主人公·有马拓也在两个月前失去了自己的父亲，在生活的各个方面丧失了活力。就在这样的某天，他从应该死去了的父亲那里收到了神秘装置和一封信。“收集宝玉，然后今晚10点到剑之岬来。”按照指示来到了剑之岬（三角山）的拓也却……

在剑之岬所发生的事情，拓也来到了除了他以外谁都不知晓的世界。拓也也逐渐开始理解平行世界和反射器装置。就在这时，继母·亚由美，有盯上她手中秘密的人袭击了她。拓也使用反射器装置，打算救出亚由美……

帮助了遭到袭击的拓也和亚由美的，竟然是丰富。总算是得救了的拓也和亚由美。与此同时，因为在剑之岬所发生的神秘事故，吉欧科技公司也遭到了激烈的工程反对运动。工程负责人的亚由美被慢慢地逼上了绝路……

拓也非常担心被逼上绝路的亚由美。出现在这样的拓也面前的是自称为记者的名为朝仓香织的人物，并向他提出了能够拯救亚由美的交易。而拓也在学校接到了吉欧科技公司的人所打来的确认亚由美的所在处的电话。心生不安的拓也赶回了家中，在那里他看到的是……

拓也为了拯救亚由美而无数次使用反射器装置穿越着平行世界。然而他却丝毫不能阻止悲剧的发生。看似走投无路的拓也，突然想起了与香织之间的交易。然后拓也来到了香织的所在处……

拓也总算是停止了亚由美身上悲剧的螺旋，为了找到亚由美是清白的证据，和香织一起侵入了吉欧科技公司。拓也在吉欧科技公司的中枢区域所看见的是……

证明了亚由美的清白，并成功解救了她的拓也，由于混沌矫正的作用下而再次前往了新的平行世界。拓也与澪、结城一起来到了有着作祟骚动传言的地点·龙藏寺的住宅中。而后龙藏寺提出了要与拓也两个人谈话……

在父亲·岛津市长的安排下澪要突然转学到国际学校去了。留在这座城镇的所剩无几的时间里，澪为了解开三角山的谜团而卯足了干劲，还因此受了伤。在保健室被拓也包扎了伤口的澪，打算向他阐明一切事情……

本应该只对拓也说过的秘密被公布于世，非常伤心的澪打算利用剩余的时间到三角山进行搜索，决定要离家出走。拓也和美月、结城一起开始寻找澪，而这时结城却突然说出了真相……

寻找澪而潜入了三角山洞穴的拓也，利用反射器装置规避了无数次的危机，终于来到了澪的身边。而出现在寻找着出口的拓也面前的是……

在三角山地下寻找着出口的拓也和澪。到达的场所存在着令人意想不到的某种东西……以及在那里出现的美月的意图是……

拓也由于混沌矫正的作用下再次去往了新的平行世界。拓也为了能仔细地调查龙藏寺而去寻找绘里子的帮忙，但这时的绘里子看起来和平时不一样……而后出现在潜入龙藏寺家与协助者见面的两人面前的是……

拓也和绘里子暂时离开了龙藏寺的宅邸，但两人在龙藏寺的阴谋下遭到了拘束。虽然拓也使用反射装置总算避免了危机，但是也付出了很大的代价……而后得以揭晓的龙藏寺的真面目到底是……

拓也由于混沌矫正的作用下去往了新的平行世界。在这个世界上为了解开神秘少女·神奈的秘密，拓也尝试着和她搞好关系。总是跟在神奈背后的神秘男子的身影，以及拓也在神奈的房间里看到的是……

虽然神奈渴望孤独，并一直都是一个人，但是拓也、澪、结城认为同班同学之间就应该友好相处，他们决定去岛津家的私人海滩玩。虽然四人充分享受了夏天，但是反射装置和神奈的挂饰却被偷了……

纠缠着神奈的神秘男子·北条，向拓也提出了某个交易。而后拓也从绘里子那里听说了关于神奈转学的意外事实。在这样的情况下，拓也和拜访有马家的神奈交谈，拓也听了神奈的真心话……

拓也下决心要保护神奈。在这样的情况下，在龙藏寺和北条的阴谋下，神奈面临性命危机。为了拯救神奈，拓也决心前往异世界……

拓也到达了异世界德拉·格兰特。在那里，遇到了不会说话的少女塞蕾丝。在传出求救声而赶往的一个房子里，两人遇到了女剑士・艾丽娅……

艾丽娅死后，两人一起生活的拓也和塞蕾丝，两个人不知不觉生了个孩子，塞蕾丝将孩子命名为优诺。加上宠物的昆昆，三个人过着幸福的生活，突然间帝都的士兵却出现在边边境……

塞蕾丝死后，拓也和优诺为了向神帝报仇，决心穿越沙漠前往帝都。在克服危机，两人在逐渐接近帝都，却被突然出现的帝都士兵所拘束。然后，拓也被带到了被称为砂石场的“集中营”……

拓也在巴兹克支配的砂石场寻找着逃跑的机会。在那里，也收容了反抗神帝的反抗势力首领阿曼达。拓也和阿曼达合作，一起制定了逃跑计划……

阿曼达和拓也带领潜入集中营的反抗势力成员和集中营的俘虏们一起发动起义。为了阻止巴兹克的阻挠，两人在加塞尔之塔上展开战斗，却由于塔的崩塌而被困在了塔顶上。在束手无策的两人面前出现的是……

拓也和阿曼达一起到达了帝都，和反抗势力进行会合。为了打倒神帝，拓也和反抗势力一起潜入了城堡。帝都的刺客·面具女出现在他们面前……

拓也等人甩开了面具女，进入了地下监狱，龙藏寺正被关在地下监狱里。龙藏寺向拓也提出了一个交易。而后终于到达神帝所在处的拓也，在那里知道了神帝令人意外的真实身份……

为了拯救德拉·格兰特，是必须要牺牲优诺的……虽然拓也对这不讲理的事实感到震惊，但听了优诺的决心后两人海事决定拯救德拉·格兰特。于是一行人开始了巫女的仪式，而此时维度犯罪者·龙藏寺为了妨碍仪式的进行而发起袭击……

面对展现压倒性强大力量的维度犯罪者·龙藏寺，拓也等人陷入了苦战。而此时维度监察官艾莉可和一个意外人物突然出现……一行人到底能否避免德拉·格兰特的危机呢？以及拓也和优诺的命运又会何去何从呢？！