Het is de Taisho-periode in Japan. Tanjiro, een goedhartige jongen die voor zijn levensonderhoud houtskool verkoopt, vindt zijn familie afgeslacht door een demon. Tot overmaat van ramp is zijn jongere zus Nezuko, de enige overlevende, zelf in een demon veranderd. Hoewel hij verwoest is door deze grimmige realiteit, besluit Tanjiro een ‘demonendoder’ te worden, zodat hij zijn zus weer in een mens kan veranderen en de demon kan doden die zijn familie heeft afgeslacht.
Eerstejaarsstudent Hiro Amanokawa activeert een mysterieus apparaat dat zijn vader heeft achtergelaten, genaamd 'Digivice', dat onbekende wezens die niet door gewone mensen kunnen worden gezien, de Digimon, zichtbaar maakt voor zijn ogen. Dit is het verhaal van deze andere kant van de wereld waar niemand zich van bewust is. Met hun vrienden duiken Hiro en Gammamon in de mysterieuze wereld waar deze wezens leven.