Los corruptos creadores de la Casa de Muñecas, un centro de alta tecnología, ganan millones de dólares reprogramando sin parar a Echo y los demás activos para satisfacer todas las demandas de sus clientes, solucionando sus problemas o proporcionándoles todos sus caprichos.

Un psicópata convierte el tiempo que pasa con Echo en una cacería mortal, mientras Boyd, al que han dejado imposibilitado, no puede protegerla; y el agente Ballard consigue la primera pieza del rompecabezas que le permitirá demostrar la existencia de Dollhouse.

Echo se transforma en corista de una diva para protegerla de un fan enloquecido; y el Agente Ballard cae en una trampa mortal que le ha tendido la mafia rusa.

Echo lidera con éxito una misión con un equipo experto en cajas fuertes cuando una llamada de teléfono le borra la memoria; Sierra debe asumir la misma personalidad para cumplir la misión; y el agente Ballard da un ultimátum a Lubov.

Echo, esta vez una mujer ciega e inocente, salva a los seguidores del malvado líder de una secta; y la realidad de la existencia de Dollhouse queda cada vez más clara para el Agente Ballard cuando ve por primera vez a la mujer que él conoce como Caroline.

Ballard irrumpe en una casa propiedad de un magnate de Internet que está muy apenado, y se encuentra con Echo inesperadamente; cuando se vuelven a encontrar, Echo lo mete en una pelea a puñetazos.

Una misteriosa droga que afecta la memoria de todos los alumnos de una universidad hace que Echo regrese al lugar donde comenzó todo, y el personal de Dollhouse al completo cae víctima del alucinógeno.

Echo ayuda a liberar a los Activos; recuerdan partes de sus verdaderas personalidades, y descubren los dolorosos motivos que los llevaron a decidir entrar en Dollhouse.

Agent Ballard's investigation into the Dollhouse gains momentum when he gets a photo of Echo. Meanwhile Echo and some of the other Actives start to show signs of self-awareness, making Adelle and the handlers nervous.

Cuando Adelle, Boyd y el resto de personal de Dollhouse temen por la evolución de las personalidades impresas en Echo, deciden llevarla al Ático, desvelando por fin el sitio dónde son llevadas las mentes vacias y demás.

Topher corre para reconstruir la personalidad original de Echo (Caroline) cuando Adelle se da cuenta que son la clave para evitar un futuro devastador. Mientras tanto, se revelan la relación de Echo y Caroline en el pasado y la identidad del misterioso líder de la Corporación Rossum.