Le Dr Alexander Kline, un scientifique biologique, considère son travail comme maléfique, et pour le prouver, il prévoit de libérer un germe mortel qui tuerait des milliers de personnes. Trois vaches mortes mènent McGarrett dans une poursuite désespérée pour retrouver la toxine, impliquant un opérateur téléphonique amical et les meilleurs agents de Washington.

La toxine mortelle du Dr Kline est perdue, il réfléchit à son plan et McGarrett doit trouver le flacon avant qu'il ne se désintègre et n'empoisonne toute l'île. La toxine fait déjà son travail mortel alors que des personnes innocentes entrent en contact avec elle.

Danno tire sur un adolescent apparemment armé mais découvre qu'il s'est trompé, et l'opinion publique et le frère de l'adolescent se retournent contre lui. McGarrett doit agir pour désamorcer la situation potentiellement explosive.