Nagi es una adolescente pesimista que sueña con Upananta, un mundo de fantasía en el que los peces nadan por el cielo. Este mundo se encuentra al borde de la destrucción y acaba de perder a su grandioso héroe dracojinete.

Thaim cree que Aktha sigue con vida. Junto a la excéntrica Saila, intenta desentrañar la verdad oculta de otro mundo para encontrar a Aktha. En Yokosuka, Nagi busca el secreto que hay detrás de lo que sueña. Cuando entra en el estudio impoluto de su madre, le ocurre algo desconcertante.

Nagi se queda atónita al ver a Thaim aparecer de la nada. Al principio se muestra recelosa, pero cuando se entera del motivo por el que ha llegado a su mundo, decide ayudarle en su misión de buscar a Aktha. Sin embargo, a ambos les espera una sorpresa desagradable.

Thaim por fin encuentra a Aktha, pero descubre que el gran héroe no es el mismo al que admiraba. Aktha rechaza la petición de Thaim de unirse a él. Incapaz de aceptar un no por respuesta, Thaim desafía al poderoso héroe a un duelo.

Los secretos siempre salen a la luz. El último esfuerzo desesperado de Saila por salvar el mundo revela la verdad oculta sobre Upananta. Sin embargo, hay secretos que es mejor no revelar. Por desgracia para Thaim, él acaba de descubrir uno muy peligroso.

La emotiva reunión de Nagi con su madre queda interrumpida por un perverso intruso. El asaltante les pisa los talones a Thaim y Nagi, que se dirigen a la isla donde se esconde Aktha.

Thaim está muy afectado por el sacrificio de Nagi. El rugido de su dragón le perfora los oídos y hace despertar un nuevo poder. Mientras tanto, la fuerza del mal de Upananta empieza su destructiva transformación.

Los dragones de Aktha y Supes enloquecen bajo el control de Pytonpyt. Thaim y Aktha deben viajar al Núcleo Ancestral y destapar la verdad oculta para detener la invasión de Pytonpyt.