King Bradley dimostra tutta la sua brutalità nella battaglia contro Greed. Ma l'uomo che distrugge lo Scudo perfetto è più forte anche del Comandante.

Verità preoccupanti vengono a galla quando Al trova colui che viene chiamato il Padre. Ed ancora una volta infrange il più grande tabù dell'alchimia.

Gli Elric affrontano Padre, ma non possono fare nulla quando lui si mette a creare homunculus con un'alchimia che sembrava impossibile.

Winry viene rapita da Scar e non c'è ancora un piano per salvarla. Una fortissima tormenta s'avvicina, ma solo Alphonse Elric riesce ad affrontarla.

Molto tempo fa, il sangue di un povero schiavo è stato usato in un esperimento per dar vita a una strana creatura informe.

Gli sforzi di May e Marcoh per decifrare la ricerca del fratello di Scar iniziano a dare frutti, ma potrebbe essere troppo tardi per impedire la catastrofe.

I piani di coloro che si apprestavano a reclamare la terra vengono rivelati e l'assassinio di un potente leader crea il caos.

Dopo aver esplorato le intricate origini dell'albero genealogico dei Bradley, Mustang riunisce i suoi soldati più fedeli.

Edward scopre che Envy vuole portare scompiglio nel gruppo. Le cose cominciano a cambiare durante la battaglia tra i fratelli Armstrong e Sloth.

Finito uno scontro, ne comincia un altro. Hohenheim e il Padre si affrontano per il possesso della pietra filosofale.

Padre elabora la propria fuga mentre Bradley affronta potenti avversari durante l'attacco al quartier generale centrale.

Ling sfrutta la potenza di Greed per distruggere il nemico davanti al cancello. Intanto, Edward trova Van Hohenheim e cade in una trappola.

Mentre Edward, Alphonse, Van Hohenheim, Izumi e Mustang aspettano che si compia il loro destino nel nascondiglio del Padre, la situazione precipita.

Come programmato, il Padre assorbe tutte le anime di Amestris e si appresta a inglobare la Verità attraverso un portale apertosi nel cielo.

Un'eclissi dà speranza alle anime di Amestris, mentre Hohenheim rivela un piano preparato molto tempo prima. Edward affronta Pride per l'ultima volta.

Edward, Armstrong e Izumi trovano il modo d'indebolire gli intensi attacchi del Padre, mentre Alphonse si sacrifica per aiutare il fratello.

Dopo un chiarimento finale con il Padre, Edward ripaga il sacrificio di Alphonse con il proprio. Van Hohenheim trova finalmente la pace.