離開露露卡島之後原本以為可以暫時得到平靜,沒想到突然有好多東西從天而降,最離譜的是有一艘大型帆船也掉下來,而且娜美的記錄時針也好像壞掉了,妮可羅賓卻說這是因為空島的引力…

路飞他們到了這片海域,不但突然掉了一艘大型帆船下來,突然跑出一個自稱是打撈王的人猿,更可怕的是又跑出一隻像陸地一樣大的大海龜,即使如此娜美還是一心一意想要找到"空島",現在唯一的線索就是到加亞島去問人;另一方面沒想到巴其海賊團也到了偉大的航道,還有路飞的哥哥艾斯居然也出現在他們的船上…

路飞他們好不容易來到了加亞島魔谷鎮,沒想到這裡竟然是個充滿兇神惡煞的地方,不是打打殺殺就是槍彈相向的情景,娜美為了收集到"空島"的情報要路飞跟索隆兩個人絕對不能鬧事,路飞也說好自已絕對不打架…

路飞為了信守約定要自己跟索隆都不能動手,最後果然被"鬣狗"貝拉密打得很慘,而且也沒有探聽到"空島"的線索,幸好妮可羅賓有了一點收穫他們決定先去找一個被加亞島驅逐出境的夢想家蒙布朗庫力凱,沒想到一出海又遇到了打撈船…

帶著唯一的線索,路飞他們來找一個叫蒙布朗庫力凱的夢想家,原來他就是"大騙子諾蘭德"的子孫,而諾蘭德也是庫力凱所知唯一相信空島的人不過在這同時貝拉密一夥人也得知這個線索,庫力凱希望人猿跟猩猩幫路飞他們完成這個夢想…

庫力凱終於對路飞他們說出了前往"空島"的方法不過他們必須掌握到"由下往上的海流"出的時機而這次的時間就是明天中午,可是庫力凱突然想到路飞他們必須先抓到能夠指引方向的"南南見鳥"才行,因此路飞一行人摸黑到森林抓鳥…

路飞他們好不容易抓到了"南南見鳥",沒想到貝拉密海賊團卻在這個時間來搶庫力凱的黃金,一心保護庫力凱老爹的人猿跟猩猩都受了重傷,因為貝拉密的"彈簧果實"能力太強,庫力凱也不支倒地,抓到鳥回來的路飞看到非常憤怒…

路飞一出拳就解決掉了貝拉密，也總算在天亮趕回去，帶著被搶走的金塊還給庫力凱，同時他們也準備出航。另一方面，海軍本部為了決定由誰來接替克洛克達爾的位子而開會，並且邀請王下七武海的人一起來…

在路飞趕回來之後他們終於要出發了，在人猿與猩猩兩艘船的護航下，總算到達了由下往上的海流可能出現的地點，只是沒想到先出現的是超大的漩渦，讓騙人布跟娜美他們都嚇到了，而且後面還有想要取路飞人頭的黑鬍子海賊團追趕…

路飞他們順著可怕的〝由下往上的海流〞，總算到了天上，回神之後發現船外一片白茫茫的景色，不過很快地就被不知名的人從天而降襲擊，幸好有自稱是天空騎士的甘福爾出面營救。不過一波未平一波又起，他們又在天國之門監視官亞馬遜面前被丟進了一條往上衝的雲河…

在特快蝦的引導下，路飞他們終於到了空島，也就是所謂的神之國（SKY PIEA）。一到了這裡，他們就遇見了像天使一樣的女孩柯妮絲，以及她的父親派葛亞。派葛亞還把這裡的交通工具威霸借給娜美，並且盛情招待一行人到他們家作客…

在柯妮絲父女的接待下，路飞一行人除了飽餐一頓〝天珍海味〞之外，也得知了〝貝〞對空島生活的重要程度。空之民最敬畏的神聖之地–神之島，是個絕對不能進去的地方。但是沒想到路飞卻對神之島抱持著高度興趣，同一時間，娜美竟然接近了這個神之島…

看到神之島天的制裁的娜美，急著趕回來通知路飞他們，沒想到白貝雷部隊已經早一步找到路飞等人。原本路飞他們只是非法入國罪名，可是白貝雷部隊隊長麥金利卻故意害他們的罪越來越重，甚至要被判〝雲浮流〞的死刑…

路飞他們在麥金利的逼迫下，從非法入國者的罪名升到第二級重大的罪犯，為了不拖累柯妮絲跟派葛亞路飞他們決定先離開天使海灘再說。只是沒想到先上船準備出航的娜美、喬巴、妮可羅賓跟索隆他們，竟然被巨大的蝦子帶到了神之島…

在娜美他們被〝超特快蝦〞帶走之後，路飞跟香吉士、騙人布三個人不得不去〝神之島〞（UPPER YARD）的〝活祭品祭壇〞救他們。柯妮絲不但為他們帶路，還在碼頭準備好了船。路飞發現柯妮絲似乎不太對勁，一問之下柯妮絲說出了真相，沒想到這時候天的制裁就降臨了…

即使聽到了柯妮絲的警告，路飞他們為了營救夥伴，還是衝向了〝神之島〞。果然一到入口就面臨了各種不同怪物的襲擊。另一方面被巨蝦帶到〝活祭品祭壇〞的娜美他們，索隆決定到森林裡探險，妮可羅賓跟娜美也跟著，只剩下了喬巴一個人留下來看守船…

來到四大試鍊之門的路飞他們，最後選擇了球的試鍊。沒想到一進入森林裡，就看到了飄來飄去的大球，原來這是〝驚奇雲〞形成的大球，而負責看守這片迷之森林的是神官之一大悟，而且路飞跟香吉士根本就不是大悟的對手…

選擇球的試鍊的路飞他們，面臨到神官大悟無情的攻擊，然而路飞及香吉士展開的反擊卻都沒用，因為他們出招前就已經被大悟看穿。另一方面，獨自留下來看守船的喬巴也面臨到空前危機，可怕的神官之一修羅出現了…

甘福爾救回柯妮絲後，帶著她及她的父親躲藏在安全的地方，沒想到他的寵物皮耶爾突然聽到哨一聲的求救聲，原來是一個人留守的喬巴遭遇到神官之一修羅的襲擊，於是立刻趕去營救。另一方面，路飞他們與大悟也陷入苦戰…

及時趕來救喬巴的甘福爾眼看就要戰勝修羅，卻不知道中了什麼計全身無法動彈，因而敗在修羅手下沈入空鯊的海裡，喬巴不顧自己不會游泳跟著跳下去救人；另一方面路飞總算找到了大悟的弱點，與香吉士兩個人合力解決掉第一個神官…

在瓦夷帕的帶領下，香狄亞戰士利用神官把注意力放在甘福爾身上的機會。攻進了目標神之社。同時擊倒神官之一大悟的路飞等人，也正朝向活祭品祭壇前進。受了重傷的甘福爾，與差點溺斃的喬巴，則是被南南見鳥救了。就在這時，來到海岸的娜美等人，發現了神之島令人驚訝的秘密！？

路飞等人順著雲河之路趕到祭壇途中，遇到了瓦夷帕等香狄亞戰士，瓦夷帕警告他們盡快離開這裡，不過在娜美的研究調查之下發現原來這座所謂的神之島，是地上的加亞島飄到天上的一部份，而諾蘭德說的黃金鄉的確是存在的…

與三個神官展開大戰的香狄亞戰士，由於蘭奇要保護愛紗的〝VIRS〞（大地）造成失誤，讓卡馬奇利為了救她而身受重傷，香狄亞也因此不得不撤退。另一方面，路飞他們在會合之後，娜美對著大家解開黃金鄉之謎，並且知道黃金藏在什麼地方…

在快樂的營火晚會之後，路飞等人在湖邊紮營休息，沒想到隔天醒來，卻發現黃金梅利號已經不知道被什麼人修好了。為了尋找黃金，騙人布想辦法把黃金梅利號從活祭品祭壇放下來，只不過必須由喬巴當作誘餌…

在娜美的分配下，路飞他們分成了兩隊分別行動。探索隊的路飞、喬巴、索隆、羅賓這組目的是要尋找黃金，另一邊則是娜美、騙人布、香吉士組，是負責把船開到會合的地點，並且照顧受傷的天空騎士甘福爾。另一方面香狄亞戰士也將再次攻向神之社…

瓦夷帕帶領的香狄亞戰士們為了擊倒艾涅爾，一行人攻向了神之社。但是以心綱看穿這一切的艾涅爾，開放整座島給神官作為試鍊的地方，讓神官及神兵們，與香狄亞人以及藍海人也就是路飞一行人，展開了一場生死交戰的生存遊戲。

由於路飞他們沒有照瓦夷帕的話離開這裡，不但路飞遇到瓦夷帕時展開了決鬥，索隆也遇到了香狄亞的戰士布拉哈姆，兩人也展開了前所未有的空中戰，最後索隆是用飛躍的斬擊〝一刀流三十六煩惱鳳〞擊敗了布拉哈姆！

路飞遇上了香狄亞的戰鬼瓦夷帕，兩個人也展開了死鬥，雖然路飞有著所向無敵的橡膠能力，不過瓦夷帕也有著威力驚人的〝燃燒砲〞。就在兩人打得難分高下時，路飞竟然掉到一個很詭異的地方。另一方面，在黃金梅利號的娜美他們遭到艾涅爾突襲，香吉士跟騙人布都被艾涅爾擊倒了…

迷路的喬巴不知不覺中踏進了神官涅槃的地盤，涅槃佈下的是〝沼的試鍊〞。涅槃雖然做事老是少一根筋，不過他的沼雲仍然十分厲害。喬巴本來一心想逃，最後他想既然逃不了就跟涅槃一決勝負，讓自己成為真正的海賊…

娜美為了救被燒焦昏迷不醒的香吉士跟騙人布，與甘福爾聯手擊敗了中悟跟小悟，不過甘福爾也隨即趕去追艾涅爾。不料這時柯妮絲父女載著愛紗來到黃金梅利號旁，害怕的愛紗一心想要救自己的族人，因為她感覺得到他們的聲音一個個消失了…