2077年，一群自由派恐怖分子在处决现场利用时空穿越装置穿越，警察吉拉也被卷入穿越到2012年。恐怖分子们穿越后密谋改变历史，只有吉拉能阻止他们。吉拉利用CMR装置向总部求援时，17岁的科技天才艾莱克意外截获她的信号，原来CMR正是由长大后的艾莱克发明，两人成为“特殊”的朋友。吉拉认识了警探卡洛斯，并伪造身份混进警局抓捕逃犯。

吉拉的假身份被戳穿，卡洛斯将她逮捕。恐怖分子控制了电网，试图启动时空穿越装置返回未来，失败后他们劫持了弗雷泽教授，让弗雷泽帮他们利用对撞机启动穿越装置。为了重返家乡，吉拉从警局逃了出来并和敌人暂时合作。一声巨响，计划还是失败了。在艾莱克的帮助下，吉拉再次获得了联邦调查局特工的身份。吉拉在警局看到穿越装置器缺的那一块被送进了证物室。

恐怖分子成员凯洛格私下来找吉拉，并表示要帮她抓其他队友，凯洛格想过安稳的生活。一批死者的体液被抽干了，吉拉调查出是恐怖分子的人干的，他们想合成一种血清救首领特拉维斯。凯洛格将成员柯蒂斯引了出来，吉拉将柯蒂斯击毙。吉拉根据追踪器在一所房间发现了被绑的凯洛格，房间里放了爆炸装置，吉拉和凯洛格死里逃生。吉拉晚上来到来到证物室，拿走了穿越装置的碎片。

一名叫莉莉·琼斯的女孩被杀死，这正是吉拉外祖母的名字，恐怖分子盯上了吉拉家族。吉拉找到了祖母莉莉，这女孩与吉拉想象的截然相反，是个粗鲁的不良少女。卡加梅绑架了凯洛格的外祖母马蒂，想用马蒂来交换莉莉。交换现场，凯洛格早就劫持了卡加梅的母亲，卡加梅只好放人，但马蒂却被暗处的特拉维斯打死，出乎意料的是凯洛格并没有消失。

Liber8决定重塑他们的公众形象，而Kiera必须救出一个遭绑架的CEO。Kagame决定采取新的策略来实施「革命」－－获得知识分子和基层民众的支持，特别是那些仇视政府及大型企业集团的人。为此，他命令自己的战士们绑架一个大型企业的CEO，当众对其进行羞辱和「惩罚」。为了救出该CEO，Kiera和Carlos不得不与时间赛跑。

警方发现Alec的继父购买了过量的化肥，而这些东西可以被用来制造「土炸弹」，于是Carlos和Kiera来到Alec继父的农场进行调查。Alec的继兄和一群少年使用武力劫持了Kiera、Carlos、Alec、Alec的母亲和继父，并打伤了Carlos。警方闻讯后赶来封锁了现场，双方陷入对峙状态。Alec在关键时刻修复了Kiera的紧身战斗服，Kiera制服了这群「少年恐怖分子」，但却付出了高昂的代价。与此同时，Alec的继兄乘乱逃跑，正式投入Liber8组织。心情沮丧的Kiera找到亦敌亦友的Kellogg，两个人很有可能……这是一个让人大跌眼镜的变化。

故事紧接上一季结尾，Kiera阻止了Liber8组织发动的恐怖袭击，但事情却远不止这么简单。当本季开始之时，市长被大胆的刺客刺杀，已经消失了一段时间的Kiera不得不再次出现，与Carlos联手调查这起案件。与此同时，Kiera尝试与Alec重新取得联系并缓解他们之间的紧张关系，但是Alec在读过未来自己所留的信息之后已经完全变了一个人。

Alec和他的「朋友」偷了一辆车出去兜风，但他在随后发生的车祸中受了伤。Kiera认出他的「朋友」使用的新型毒品来自未来世界——糟糕的是，这种毒品正快速在温哥华的街头扩散。Kiera确信Liber8组织该为此事负责。Julian的母亲去监狱探望他，唤醒了他内心的「斗争」欲望。不过，这一次他打算向一个全新的方向奋斗。与此同时，Sonya和Travis的战争进一步升级，双方都利用街头黑帮作为自己的「人肉武器」。

作为城市购物中心爆炸案的重要嫌疑人，Julian将出庭接受审讯。当Kiera和Carlos获悉Liber8组织打算破坏庭审过程的消息后，立刻着手挫败他们的阴谋。与此同时，Alec必须在讲真话和背叛家人之间做出选择。现在的问题是，有人会相信他的「真话」吗？

Alec的母亲被一颗子弹击中——但凶手行刺的目标原本是Julian。为阻止Julian变成未来那个凶残的恐怖分子，Kiera必须决定自己愿意做哪些事情。但是她如果走得太远，势必让Dillon的新「Liber8」特遣队面临考验。

Kiera 竞相将 Alec 从自己手中救出，并保住自己回家的机会。 Alec 必须在解决 Kiera 的困境或他自己的困境之间做出艰难的决定。

一系列银行劫案都与Liber8组织有关，Kiera在调查中发现这些劫匪都受到最近刚刚逃脱的Lucas的控制。Carlos在不情愿的情况下对时间旅行有了「新认识」，这也开始影响到他的工作。