Die 48 Tage der zweiten Gruppe der Überlebenden aus dem Flugzeugheck werden geschildert. Ana Lucia, Mr. Eko, Libby, Cindy, Bernhard und Goodwin haben entsetzliche Erlebnisse und kämpfen gegen die gefürchteten "Anderen".

Die Überlebenden des Flugzeugabsturzes sitzen noch immer auf der Insel im Pazifik fest. Jack, Kate und Sawyer entdecken nach und nach, dass sie sich aus der Gefangenschaft "der Anderen" nicht leicht befreien werden.

Jacks freudiges Wiedersehen mit den Überlebenden ist jäh vorbei, als diese sehen, dass er von einer "der Anderen" begleitet wird, und Claire bekommt plötzlich eine geheimnisvolle, lebensbedrohliche Krankheit.

Als Juliet und Jack Charlotte und Daniel verfolgen, wird Juliet plötzlich mit der Psychotherapeutin aus der Siedlung konfrontiert. Auf dem Weg zur "Sturm"-Station finden sie Kate, die von Charlotte bewusstlos geschlagen wurde.