Un Boeing 777 semble avoir disparu des radars peu avant son arrivée à l'aéroport new-yorkais JFK. Pourtant, peu après, l'appareil est bien retrouvé sur le tarmac, mais ne donne aucun signe de vie. Dépêché sur les lieux, épistémologiste Ephraim Gooweather découvre à l'intérieur de l'appareil que tous les occupants sont morts.

Gus parvient à livrer le cercueil dans un parking sous-terrain désert, mais prend la fuite après avoir entendu un bruit effrayant en sortir. De son côté, Ephraim tente de garder les survivants en quarantaine contre l'avis de ses supérieurs. Abraham, toujours en détention, reçoit la visite d'une vieille connaissance...

Eph, Nora et Jim sont sous le choc de la transformation de leur patient, le capitaine Redfern, en une créature maléfique. Ils pratiquent une autopsie et découvrent que le métabolisme de ce mutant défie les lois de la nature. Eph prend conscience que ce phénomène doit être stoppé à tout prix. Jim lui avoue alors qu'il a fauté en laissant passer la mystérieuse boîte lors des contrôles à l'aéroport. De son côté, Ansel, l'un des rescapés, comprend qu'il est rongé par un mal incurable...

Vasiliy Fet travaille à créer une bombe lumineuse en augmentant la puissance des lampes à ultraviolet dont ils disposent. Equipés de leurs armes de fortune, de lampes et de cette bombe artisanale, le petit groupe de chasseurs de vampires s'engage dans les tunnels du métro, espérant pouvoir affronter et tuer le Maître pour mettre un terme à l'invasion de ses créatures. Pendant ce temps, Zach est resté seul au magasin du prêteur sur gages en compagnie de Mariela, la mère de Nora, qui n'a plus toute sa raison...