Après que le capitaine Black ait détruit une ville étrangère sur Mars, ses actions déclenchent l'horreur des Mysterons, qui, en cherchant à se venger, commencent par tenter de tuer le président mondial. Les Mysterons utilisent les reconstitutions de deux officiers du Spectre, dont l'un, le Capitaine Scarlet, revient à la vie, non seulement mais aussi hors de leur contrôle, après être tombé de 800 pieds à sa mort....

La première mission de Scarlet, avec ses pouvoirs de rétrométabolisme qui lui restent, est de protéger le directeur général de la République unie d'Asie de l'assassinat par les Mysterons, qui doit quitter Londres en jet privé. A l'insu de Spectrum, un vol international en provenance de New York a été détruit et recréé, et est en fait un piège qui attend de frapper....

Un dispositif atomique, transporté sur un chantier de construction, est détourné et caché. Les capitaines Scarlet et Blue, ont jusqu'à midi pour le trouver et sauver Londres de la destruction totale. Le seul indice qu'ils ont vient du chauffeur qui le livre, qui prétend que Big Ben a sonné Treize....

Au Culver Atomic Centre, situé dans le Yorkshire, en Angleterre, le capitaine Black s'expose accidentellement à un isotope radioactif à court terme, lorsqu'il est détecté par les agents de sécurité, ce qui le fait hésiter. Bien que l'isotope soit physiquement inoffensif, il est une cible facile à atteindre lorsqu'on utilise des systèmes de suivi des rayonnements pendant la chasse à l'homme à grande échelle de Spectrum, pour découvrir et appréhender l'agent Mysteron. Mais quand l'organisation est leurrée, les Blacks parviennent à enlever Symphony Angel, qui désobéit aux ordres directs du colonel White. Au lieu de maintenir sa mission de surveillance aérienne, elle se retrouve sur le couloir de la mort, dans une chambre à radiation, et Black en contrôle absolu, avec le choix de la tuer, ou de la laisser partir libre.

Un char de dernière génération, l'Unitron, un véhicule mortel assisté par ordinateur, est saisi par les Mysterons pour détruire le Commandant Suprême des Forces Terrestres, quand il est escorté par le capitaine Blue au champ d'essais des chars dans le désert du Sahara. Deux des officiers les plus haut gradés du commandant, le colonel Storm et le major Brooks, alors qu'ils se rendaient au quartier général de la SHEF, sont tués dans une collision explosive dans un tunnel intégré à la montagne, impliquant leur voiture et un camion-citerne à essence, et retrouvent ainsi la vie avec des corps "Mysteronisés". Les deux hommes sont utilisés pour compléter la menace du Mysteron, la tentative du major Brooks échouant, mais la situation du colonel Storm se transforme en danger de mort lorsqu'il accompagne le commandant suprême au point 783, le poste de commandement intérimaire où les deux coordonnateurs des essais effectuent les derniers essais avec l'Unitron, mais ils ne savent pas que les Mysterons ont re-programmé la puissante arme.

Lorsqu'une station radio relais et un satellite de communication sont recréés par les Mysterons et que leur cap est modifié en direction de la base des nuages, le colonel White ordonne que le missile mortel soit détruit avant d'entrer en collision avec la base aérienne. Exaspéré contre son supérieur pour avoir ignoré la vie des hommes à bord du satellite qui n'existaient pas, mais que Scarlet connaissait, il refuse la proposition de White d'être commandant en chef temporaire de la base Nuageuse, et par conséquent, l'offre est remise au capitaine Blue, qui est honoré. Partant pour une destination subreptice, que seul White a exposée au lieutenant Green, et avec de dures instructions pour ne la publier à personne, il arrive à bord du sous-marin USS Panther II, sous l'alias Robert Snow, où peu après un des officiers du pavillon est, avec intention, assassiné et reconstruit par les Mysterons dans leur nouveau jeu de vengeance pour tuer le Colonel White.

Le général J.F. Tiempo, commandant du Western Regional World Defence Government, est la prochaine cible des Mysteron, et le médecin qui effectuera une opération majeure sur Tiempo est éradiqué lors d'un accident de voiture dramatique impliquant le capitaine Black, et reconstruit par les Mysterons.

Une réunion top secrète est organisée entre le Président mondial et deux officiers de l'Agence du renseignement sur le spectre, dont un général et un médecin scientifique, qui a créé un nouveau canon et détecteur électrique Mysterons.

L'Unitron, un véhicule mortel assisté par ordinateur, est saisi par les Mystérons pour détruire le Commandant Suprême des Forces terrestres.

Les Mysterons présentent à Spectrum leur nouvel acte de vengeance ; pour tuer l'un des pilotes Angel, et avec Destiny en vacances, elle est leur cible apparente, alors les capitaines Scarlet et Blue se rendent à Paris pour la récupérer et l'accompagner à Cloudbase.

Une fusée à géométrie variable est piratée par un Space Major Reeves, un vieux complice du Colonel White.

Les capitaines Scarlet et Blue se rendent dans l'Himalaya pour superviser et administrer la nouvelle phase de Spectrum afin de surveiller les signaux d'un satellite spatial qui a été lancé sur l'orbite entourant Mars et de prendre des photos détaillées à haute résolution de la planète.

Alors qu'il se détend dans un élégant restaurant de campagne en fin de soirée, Captain Blue, accompagné par Captain Scarlet, commence à se sentir bizarre après avoir bu une tasse de café noir.