Molly inizia a cambiare fisicamente, ma non è sicura che il processo si possa invertire, nel frattempo si convince che gli alieni siano sulla terra per ragioni pacifiche. Lei e JD raggiungono Tobias per i negoziati di pace con gli alieni. Inoltre, l'ex moglie di JD riappare per parlare della loro figlia.

Molly e JD sperano che la pace possa arrivare e incoraggiano Tobias a mediare un accordo tra gli esseri umani e gli ibridi, mentre Lucy cerca di manipolare i sentimenti di Charlie e di metterlo in una posizione compromettente. JD diventa scettico sugli alieni dopo che uno di questi gli provoca un flashback sul periodo in cui era un soldato al fronte.