Un homme condamné à 25 ans de prison pour meurtre contacte Jane. Il lui demande de l'aider à prouver son innocence, en échange d'informations sur Red John le tueur en série sadique qui a assassiné la famille de Jane...

Patrick Jane doit trouver un moyen pour que des jeunes gens turbulents, participant à un programme éducatif spécial pour ados en difficulté, se confient à lui. Il cherche en effet à découvrir comment l'un d'entre eux est mort, son cadavre ayant été retrouvé dans la forêt...

L'agent Cho est appelé sur une affaire le concernant de près. Une fusillade à Oakland a fait une victime non identifiée, un asiatique d'une trentaine d'années, tatoué, appartenant probablement à un gang. Celui-ci a passé trois coups de fil à Cho les jours précédents sa mort. En effet l'agent Cho le connaissait : il s'agissait de David Seung, sorti de prison six mois plus tôt, membre des Playboys d'Avon Park, un gang auquel appartenait Cho. Patrick Jane va aider Cho dans cette enquête non-officielle.

Jane reçoit un mystérieux appel d'un inconnu qui lui demande une faveur. Après un coup de téléphone anonyme, une équipe du CBI se rend sur la scène d'un crime et trouve Jane penché au-dessus du corps de la victime, une arme à la main. L'homme est Lester Wale, un homme d'affaires qui a également été la victime d'une arnaque mise au point par un certain Danny Raskin. Les enquêteurs découvrent bientôt que c'est Danny Raskin lui-même, le beau-frère de Jane, qui l'a appelé au moment du meurtre. En partant à la recherche de Danny, Jane est forcé de se replonger dans son passé et dans le souvenir de la mort de sa femme...

Le corps dénudé d'une jeune femme a été retrouvé sur la plage occidentale de l'île de San Felix. Cette dernière a subi de graves blessures et a été violée avant sa mort. L'équipe du CBI est chargée de l'enquête. Mais la victime n'a aucun papier d'identité et les habitants de l'île ne la connaissent apparemment pas. Ceux-ci prétendent que le corps est parti du continent avant de s'échouer chez eux. Patrick n'est pas convaincu par ces propos. Il décide de rester sur l'île et d'observer ce qu'il se passe. De son côté, Grace, accompagnée de Cho, rencontre la petite amie de Wayne, Sarah Harrigan. Mais elle se met à devenir jalouse après ce rendez-vous...