1° episodio - Change 1 New York: Musashi combatte da solo con le tre Macchine Getter contro orde di Mecha-Saurus inviati da Re Gool, mentre, al laboratorio di Saotome, Ryoma (ferito e privo di memoria) e Hayato tentano invano di attivare un nuovo Getter Robot per correre in suo soccorso. Dopo essersi ben destreggiato a lungo, il Getter Robot viene immobilizzato dalla morsa dei vari Mecha-Saurus. L'unico modo che resta per non perdere la guerra è una manovra kamikaze: Musashi estrae dall'interno del robot il generatore di Raggi Getter e lo fa esplodere. La violenta deflagrazione ha effetti devastanti. Nonostante le apparenze, non vi è certezza che l'Impero dei Dinosauri si sia estinto. Due anni dopo, Hayato, in qualità di dirigente della Base Nisar, è impegnato nell'addestramento di alcuni piloti per una nuova arma da guerra: il Neo Getter Robot, alimentato dall'Energia al Plasma (lecito attendersi che, dopo New York, l'energia Getter non goda più di molta fiducia). Dopo averne arruolati due (la bella Sho e l'imponenete Gai) gliene serve un terzo. Il prescelto è Go Ichimonji, un ragazzo diciassettenne sprezzante del pericolo, che, dopo aver perso i genitori cinque anni prima per mano degli uomini-rettile, si guadagna da vivere come lottatore clandestino. Proprio durante un incontro, affronta un rettile inviato per catturarlo. L'Impero dei Dinosauri esiste ancora ed intende annientare l'umanità anche attraverso il reclutamento forzato dei migliori esemplari del genere umano. Go riesce a cavarsela egregiamente, ma subito dopo la fine dell'incontro, un Mecha-Saurus attacca la città. Hayato riesce così a convincere Go ad unirsi alla squadra Getter. Il giovane ha quindi in battaglia il suo battesimo di pilota del Getter 1. Battaglia che viene vinta dai nostri eroi. L'episodio si conclude con l'inquietante immagine di un Re Gool che, con l'aiuto di un rigeneratore, sta per tornare a nuova vita, sotto lo sguardo ammirato dei suoi fedeli Bat e Galek.

2° episodio - Change 2 Sho, Gai e Go si addestrano alla guida delle tre Neo Getter Machines. Al loro rientro assistono da uno schermo alla caduta di migliaia di meteoriti sugli Stati Uniti. Accorrono in difesa della Casa Bianca i due fratelli Jack e Mary King a bordo di Texas Mack, robot da combattimento dell'Esercito Americano. Le meteoriti sono in realtà scagliate da un satellite controllato dai Dinosauri. All'interno di una di esse è celato un Mecha-Saurus che ingaggia un combattimento contro Texas Mack che va incontro a serie difficoltà. In soccorso giunge il Neo Getter Robot che riesce a distruggere il mostro. Intanto un altro Mecha-Saurus è inviato per attaccare il laboratorio di Saotome, nel frattempo posto sotto sequestro militare dal Ministero della Difesa Giapponese con l'intento di bloccare la studio e la raccolta di Raggi Getter, in quanto ritenuti nocivi dopo la tragedia di New York. Neo Getter Robot riesce a rientrare in tempo per evitare il peggio. Non c'è tempo di esultare: una voce minacciosa si diffonde nello spazio ed annuncia il ritorno di Re Gool.

3° episodio - Change 3 Ryoma Nagare prega nei pressi di un tumulo di pietra dedicato a Musashi. In lontananza scorge degli strani movimenti nei pressi del Laboratorio di Saotome che, pur essendo presidiato dai militari, viene assaltato da un commando di uomini-rettile agli ordini del Generale Bat. Anche Hayato e Go, che si aggirano nei dintorni del centro a bordo di una Jeep, notano qualcosa di strano e decidono di recarvisi. Una volta giunti, trovano un'ecatombe di militari e uomini-retile. Preoccupati, si mettono alla ricerca del Dott. Saotome. In soccorso giungono anche Sho e Gai a bordo del Neo Getter Robot che è tuttavia costretto a fronteggiare un'armata di Getter Robot controllati dai Dinosauri. Go e Hayato hanno così il tempo di raggiungere l'hangar dove si trova lo Shin Getter Robot: qui trovano il Dott. Saotome salvato da Ryoma. Vista la situazione venutasi a creare, Hayato tenta disperatamente di attivare lo Shin Getter Robot, nonsotante il tentativo fallito di due anni prima che costò la vita a Musashi. Dopo vari e inutili tentativi, è Go a riuscirlo ad avviare come per magia. Lo Shin Getter Robot, alimentato ad Energia Getter, letale per i Dinosauri, riesce a sbaragliare l'armata di Getter Robot ed il Mecha-Saurus pilotato dal Generale Bat. Intanto, un violento terremoto sconvolge l'Antartide: dai ghiacci fuoriesce una gigantesca astronave controllata da Re Gool che si dirige minacciosa verso il Giappone.

4° episodio - Final Change L'astronave di Gool giunge alla Base Nisar, facendola saltare in aria. Arriva lo Shin Getter Robot per evitare ulteriori catastrofi, ma viene subito impegnato in una lotta contro un Mecha-Saurus pilotato dal Ministro Galek. Lo Shin Getter riesce ad avere la meglio, ma, nel frattempo, l'astronave di Gool giunge nei cieli di Tokyio per cominciare la sua opera di distruzione. La mega-astronave sembra impenetrabile: è impossibile farvi breccia, nonostante l'aiuto di Texas Mack, giunto dagli Stati Uniti. Per fortuna, alla fine si riesce ad aprire una breccia, grazie ad una particolare mitragliatrice inventata dal Dott. Shikishima, il folle collaboratore di Hayato alla base Nisar. In questo modo Hayato e Ryoma riescono a penetrare nell'astronave e a metterla a ferro e fuoco. Al Re Gool non resta che scendere in campo in prima persona: si trasforma in una gigantesco Mecha-Saurus ed affronta lo Shin Getter Robot. Le armi di Go, Sho e Gai nulla possono contro l'onnipotente Gool. E' ancora Go che, inspiegabilmente, riesce a scatenare una nuova evoluzione dello Shin Getter Robot. Per Re Gool non c'è scampo, così la pace torna a regnare sulla Terra.