Atteint d'un cancer en phase terminale, un professeur de chimie se lance dans la fabrication et la vente de méthamphétamines pour assurer l'avenir financier de sa famille.

Alors qu'ils viennent de rater un deal, Walt et Jesse doivent se débarrasser de deux corps, tandis que Skyler soupçonne son mari de mijoter quelque chose.

Alors que Walt tente de remettre de l'ordre après son premier deal, Skyler est à deux doigts de la vérité au sujet de la double vie de son mari.

Contraint de révéler à son entourage la vérité sur sa maladie, Walter doit trouver un moyen de financer son traitement contre le cancer.

Tandis que Jesse part à la recherche des toxicos qui ont volé la marchandise de Skinny Pete, Walt doit s'expliquer sur la source de ses revenus.

Alors qu'il se prépare à passer sur le billard, Walt tente de reprendre sa vie et celle de Jesse en main, et cherche à cacher sa source de revenus à Skyler et Walt Jr.

Après la catastrophe aérienne, Skyler met Walt à la porte, tandis que la cure de désintoxication de Jesse lui permet de faire face à son passé.

Après le meurtre de trafiquants, Walter tente de négocier un accord avec Gus pour avoir la vie sauve, quand un personnage fait son retour.

Après une troisième saison riche en suspense où Walt et Jesse se sont battus pour sauver leurs vies, quel tour Gus leur réserve-t-il à présent ?

Alors que le plan qu'ils avaient élaboré pour tuer Gus tombe à l'eau, Walt et Jesse n'ont pas une minute à perdre pour brouiller les pistes et échapper à la mort.

Walter a changé d'identité. Pour survivre, il doit retrouver les vidéos de Gus et s'assurer qu'elles ne tomberont pas entre les mains de Hank. Il lui faut entrer en contact avec Mike, qui est le seul à savoir où sont ces précieux enregistrements. Hélas, la police a déjà saisi les vidéos et les a mises sous scellés…

La police continue ses recherches sur les affaires de Gus. Elle s'intéresse notamment à une entreprise allemande, la Madrigal Eletromotive, à laquelle le malfrat était lié financièrement. Mike, lui, s'inquiète à cause de ses entretiens avec Hank. Coincé, il finit par accepter de travailler avec Walt et Jesse…

Walt est de retour à Albuquerque pour régler ses comptes. Il se rend tout d'abord chez Elliott et Gretchen Schwartz, à qui il confie une très importante somme d'argent, qu'ils auront pour mission de faire parvenir à sa famille. Le couple hésite, mais il les convainc finalement par la menace. Ensuite, Walt rend visite à Skyler pour la dernière fois et lui avoue enfin qu'il n'a pas seulement agi pour protéger les siens. Plus tard, il retrouve Todd et Lydia et leur explique qu'il a trouvé une nouvelle formule chimique permettant de fabriquer de la drogue plus facilement. Enfin, il se rend dans la cachette de Todd et son oncle…