Avviata la caccia all'uomo della DEA per catturare Tuco, Skyler include Hank nella ricerca di Walt.

Quando Hank giunge vicinissimo a scoprire il ruolo di Walt nel commercio di droga, questi escogita un piano per cancellare ogni indizio.

Mentre Skyler è certa di volere il divorzio, Walt finisce involontariamente nel mirino di due killer di un cartello della droga messicano in cerca di vendetta.

La tensione aumenta quando Walt sfida Skyler e ritorna a casa senza il suo consenso. Jesse si chiede se ricominciare con il commercio di stupefacenti.

Hank rischia la carriera, attaccando Jesse, che gli giura vendetta. Skyler chiede a Walt che gli impedisca di sporgere denuncia.

Hank dimostra che Gus è il re dello spaccio delle metanfetamine ad Albuquerque, mentre Walt teme di essere ucciso insieme a Jesse per proteggere il capo.

Mentre Skyler spinge Ted ad accettare il suo denaro per pagare le tasse, Gus insiste perché Jesse riprenda a lavorare in laboratorio da solo.

Quando il piano per uccidere Gus va in fumo, Walt e Jesse devono far perdere le loro tracce per sfuggire a morte certa.