Walter se souvient enfin de ce qu'un Observateur lui avait dit : il ne devait jamais laisser Peter retourner dans son monde à lui, faute de condamner toute l'humanité. Face au danger, Olivia décide d'aller le chercher. Grâce à l'aide de trois autres anciens cobayes traités au cortexiphan, ils réussissent à traverser avec Walter. Une fois sur place, ils se rendent à Central Park où ils ont donné rendez-vous à William par l'intermédiaire de Nina. Mais la section spéciale de cet univers-ci débarque. Le double d'Olivia tire sur Walter et le blesse. Il s'effondre à proximité d'un hôpital. William finit par retrouver Olivia qui observe son double dans son appartement...

Olivia Dunham est retenue prisonnière sur Liberty Island, dans l'univers parallèle. Elle est interrogée, droguée et considérée comme mentalement instable. Voyant en elle un atout majeur pour gagner la guerre contre l'autre monde, Walterego a demandé à Brandon de la soumettre à un traitement expérimental visant à la convaincre qu'elle est l'autre Olivia Dunham, en remplaçant ses souvenirs par ceux de son double. Mais le processus semble inefficace. Alors que Brandon s'apprête à lui faire une injection supplémentaire, Olivia parvient à s'échapper. Elle veut à tout prix retourner dans le monde réel. Elle prend un chauffeur de taxi en otage...

Dans l'univers alternatif, Olivia fait son retour à la Section spéciale où elle retrouve ses équipiers Charlie Francis et Lincoln Lee. Ensemble, ils doivent enquêter sur des accidents de la route qui semblent de prime abord le résultat d'une réaction en chaîne intentionnelle, fruit de savants calculs mathématiques opérés par un esprit aussi intelligent que retors. Bientôt, ils arrêtent un suspect, un certain Milo Stanfield. De son côté, Phillip Broyles s'inquiète du retour d'Olivia dans son équipe mais le secrétaire de la Défense Bishop lui explique l'utilité de conserver l'agent Dunham au sein de son unité...

Dans l'univers alternatif. Olivia retrouve son compagnon, Frank, qui la demande aussitôt en mariage. Mais Olivia se montre très distante avec Frank. En l'absence de Broyles, c'est Lincoln qui dirige les opérations de la Division Fringe. Un homme est retrouvé mort, victime d'une infestation d'insectes dont l'espèce est éteinte depuis dix ans...