Un mafieux, récemment libéré de prison, cherche à se venger de Max, le père de Jordan, ainsi que des trois autres policiers qui l'ont envoyé en prison il y a des années. Jordan met alors tout en oeuvre pour retrouver son père avant qu'il ne soit trop tard. Entre temps, les espoirs de Nigel et de Bug de remporter le titre de la meilleure équipe de médecins légistes du pays sont anéantis par un problème informatique.

Jordan et Woody enquêtent sur la mort de deux soldats. L'un des deux a été tué en Irak tandis que l'autre a été assassiné à Boston. Le docteur Macy n'approuve pas les fréquentations de sa fille et redoute que celle-ci se drogue.

Un violent incendie fait rage et de nombreux pompiers perdent la vie en voulant éteindre le brasier. Après plusieurs heures d'investigation, l'équipe de la morgue découvre l'existence de preuves démontrant une négligence dans la chaîne de commandement. Par ailleurs, Maggie et Macy tentent de convaincre leur fille, Abby, de poursuivre sa cure de désintoxication.

Une femme, supposée faire des miracles, est retrouvée morte, cachée sous un tas de pierres. Jordan et Woody enquêtent immédiatement sur cette nouvelle affaire. Par ailleurs, un ancien repris de justice meurt en voulant commettre un cambriolage.