Luego de haber derrotado a Dio, JoJo se casa con Erina Pendleton y se va de luna de miel en barco, aunque no será un viaje muy placentero...

JoJo sigue su enfrentamiento contra Straizo, quien le cuenta sobre los misteriosos Hombres del Pilar. Mientras tanto, el ejército nazi hace un descubrimiento en México, próximo destino de JoJo.

Con su siempre estilo burlón, JoJo se enfrenta a Santviento, quien cada vez muestra más inteligencia.

Kars finalmente logra convertirse en un ser supremo que puede dominar la vida a su voluntad y resistir la luz del sol. JoJo y compañía están en una situación desesperada donde solo pueden huir.

Jotaro Joestar es un joven de 17 años que se encuentra autorecluido en prisión debido a que dice estar poseído por un espíritu maligno. Ante tal situación, su abuelo Joseph Joestar va a visitarlo para explicarle sobre ese espíritu y contarle sobre el destino que recae sobre la familia Joestar.

JoJo y sus compañeros siguen teniendo serios problemas en el mar por culpa de una usuaria de Stand. No obstante, gracias a Jotaro consiguen superar esa grave crisis y llegan a Egipto. Allí les esperan nuevos y numerosos peligros.

Ahora que Hayato es conocedor de la trampa que tiene preparada Yoshikage, hará todo lo posible por cambiar el destino y evitar la muerte de Rohan, aparte de salvar su vida y la de su madre. Pero ¿será capaz de hacerlo?