Après avoir découvert la vérité sur les origines de Tsukihi, Koyomi tente de protéger sa sœur contre Yozuru et Yotsugi avec l'aide de Shinobu.

En retournant au présent, Koyomi et Shinobu retrouvent une ville déserte, ils comprennent vite qu'il s'agit d'une conséquence directe du sauvetage de Mayoi dans le passé. En regardant la date du journal le plus récent, ils arrivent à la conclusion que quelque chose de grave est arrivé lors des évènements de "Tsubasa Cat", ils retournent donc au sanctuaire pour trouver un moyen de revenir dans le passé.

Une femme semble chasser les morts-vivants en leur jetant du riz. Admiratif et content, Koyomi apprend qu'il s'agit ni plus ni moins d'une Mayoi qui a pu grandir. Il prétend ne pas la connaître et se présentent à leur tour. Mayoi reconnaît son nom et lui donne une lettre venant de l'homme lui ayant appris la technique du riz. L'homme n'était autre que Oshino, qui a compris ce qu'a fait Koyomi. En lisant la lettre, Koyomi et Shinobu apprennent qu'en voyageant dans le temps, ils ont voyagé dans une chronologie totalement différente.

Koyomi nous résume les événements survenus dans Tsubasa Cat et l’entièreté de Nisemonogatari