Die fünf Tage für das Bestehen der zweiten Prüfung laufen ab. Langsam macht sich bei Naruto, Sakura und Sasuke Frustration breit. Doch als sie Kabuto begegnen, macht dieser ihnen neuen Mut. Daraufhin begeben sich die Teamkollegen zum Turm im Zentrum des Prüfungsbereichs. Dort, nach der Meinung von Kabuto, hätte das Team die besten Möglichkeiten noch an die benötigte Schriftrolle zu kommen.

Naruto, Sakura, Sasuke sowie Kabuto sind auf dem Weg zum Turm im Zentrum des Prüfungsbereichs. Allerdings müssen sie schon nach kurzer Zeit feststellen, dass sie im Kreis gelaufen sind. Und als wäre das nicht genug, stellen sich finstere Gestalten ihnen in den Weg und fordern ihre Schriftrolle ein. Zudem beherrschen die Widersacher ein Jutsu der Doppelgänger.

Im Zweikampf gegen Temari ist Tenten hoffnungslos unterlegen. Egal was Tenten versucht, Temari kann die Angriffe von ihrer Rivalin mit ihrem Riesenfächer abwehren. Und so geht Temari als Siegerin aus dem Kampf hervor. Im Anschluss stehen sich Shikamaru Nara und Kin Tsuchi gegenüber. Derweil kann es Naruto kaum noch erwarten gegen seinen Kontrahenten anzutreten.

Nachdem Kampf gegen Yoroi Akado, liegt Sasuke immer noch verletzt im Krankenhaus. Sensei Kakashi erkennt die steigende Gefahr, welche durch das Mal des Fluches an Sasukes Hals, droht. Derweil schmiedet Orochimaru weiterhin seine finsteren Pläne. Lediglich Kabuto Yakushi durchschaut seine Pläne und wird somit zu einer großen Bedrohung für Orochimaru.

Um Orochimaru zu besiegen, greift der dritte Hokage zu einem sehr mächtigen Jutsu: Die Versiegelung des Totengottes. Durch dieses Jutsu wird die Seele von Orochimaru, aber auch die Seele des Hokage, an den Totengott übergeben. Der Hokage ist bereit, dieses Opfer für sein Dorf zu bringen.

Der dritte Hokage Hiruzen Sarutobi konnte Orochimaru aufhalten, indem er das Jutsu Shiki Fuujin anwendete. Dadurch konnte einerseits Orochimaru seine Arme nicht mehr benutzen, andererseits hatte die Verbindung mit dem Totengott den Tod des Hokages zur Folge. Die begabtesten Heiler des Dorfes versuchen zwar den alten Mann zu retten, jedoch bleibt jeder Versuch ohne Erfolg.

Nachdem Naruto die erste und zweite Stufe des Rasengan-Trainings erfolgreich absolviert hat, stellt er sich der dritten und schwierigsten Stufe. Der junge Ninja muss das drehende Chakra in eine Kugelform bringen, um so die Geschwindigkeit zu maximieren. Hierfür benutzt Naruto einen Luftballon, welcher bei der Übung nicht platzen oder zittern darf.

Aufgrund einer abgeschlossenen Wette mit Tsunade muss Naruto innerhalb einer Woche das Rasengan beherrschen. Um als Gewinner aus der Wette herauszugehen und somit die Halskette von Tsunade zu bekommen, trainiert Naruto mit vollem Einsatz. Obwohl Jiraiya der Sensei von Naruto ist, macht er sich nicht um seinen Schützling Sorgen, sondern um Tsunade.

Orochimaru machte Tsunade ein verlockendes Angebot. Falls sie seinen Arm heilen kann, würde Orochimaru die verstorbenen Dan und Nawaki wiederbeleben. Im letzten Moment entscheidet sich Tsunade gegen den Deal. Im Anschluss daran fordert Kabuto das Mädchen zu einem Zweikampf heraus.