Se réveillant de ce qui paraît être une suspension cryogénique, O'Neill se retrouve dans une version futuriste du SGC entouré de visages peu familiers. Les docteurs lui disent qu'il a été congelé pendant 79 ans et que le reste de l'équipe SG-1 a péri il y a bien longtemps. Les docteurs branchent O'Neill à un appareil qui transforme sa pensée en hologrammes pendant qu'il est interrogé au sujet de races capables d'anéantir les Goa'uld. Les docteurs disent qu'ils ont besoin de toute information qui peut aider dans leur guerre actuelle contre les Goa'uld. Lorsque O'Neill entend par hasard les docteurs parler avec des voix Goa'uld, il se rend compte qu'il pourrait s'agir d'un piège. Il s'échappe et découvre que le SGC n'est qu'une copie exacte construite à l'intérieur d'une forteresse Goa'uld, et que dans les pièces voisines, Daniel et Carter subissent des traitements semblables. En essayant de s'échapper, les trois sont arrêtés par Hathor qui, furieuse, s'apprête à implanter un symbiote Goa'Uld dans l'un d'entre eux...

A la suite de nombreux massacres, certains survivants annoncent qu'ils sont prêts à se rebeller contre Apophis et son armée. En rendant visite à Chulak, dans l'espoir d'organiser une rebellion, Teal'c est fait prisonnier par les Goa'uld. Pendant ce temps, à Cheyenne Mountain, le SG-C intercepte une conversation entre Apophis et Heru'ur : il y est question d'une alliance secrète pour anéantir les Goa'uld...