Un uomo d'affari e sua moglie vengono assassinati nella loro casa, inizialmente Logan e Greevey sospettano dei due figli della coppia, ma scoprono che, per ottenere finanziamenti della sua attività, l'uomo ha assunto un killer che era collegato alla mafia russa.

Un ragazzo viene trovato morto in una zona abbandonata, ucciso da dei colpi di pistola. Logan e Cerreta rintracciano subito il proprietario dell'arma, il cui figlio era amico della vittima. Quando viene interrogato, il ragazzo confessa subito di aver sparato un colpo accidentalmente, uccidendo il suo amico e di non aver nascosto la circostanza al padre, ma questa storia fa acqua da tutte le parti non solo ai detective, ma anche a Stone e Robinette.

Quando una ragazza viene trovata morta nell'ascensore del suo palazzo, Logan e Cerreta cercano di collegare il delitto ad altri due che sembrano essere l'opera di un serial killer. Quando quest'ultimo viene arrestato, i genitori di una delle tre vittime vuole che l'uomo venga condannato a morte nel suo stato d'origine, cioè il Connecticut, ma Stone e Robinette vogliono farlo processare a New York.

Due giovani tossicodipendenti in cura presso un centro di riabilitazione accusano una suora di aver molestato uno di loro. All'inizio, la versione sembra incredibile, poi però Logan e Cerreta trovano indizi che la supportano.

Logan e Cerreta indagano sull'omicidio di un commerciante di diamanti ebreo che è stato picchiato a morte e bruciato. I due sospettano prima dei quattro ragazzi neri che sono amici del figlio della vittima, ma le implicazioni razziali dell'indagine rendono il caso difficile, fino a quando non scoprono che il fratello della vittima aveva pessimi rapporti con lui.

Logan e Cerreta indagano sull'omicidio di un consigliere comunale e scoprono che l'uomo era un omosessuale non dichiarato, e che era stato ricattato per coprire il segreto. L'uomo che ricattava il consigliere è stato arrestato, mentre l'unico testimone, che anche lui era ricattato, non vuole testimoniare. Anche il padre della vittima ostacola le indagini, per coprire il segreto del figlio.

Logan e Cerreta indagano sull'omicidio di un leader afroamericano avvenuto durante una cerimonia. L'indagine è complicata da un rifiuto da parte degli amici e dei seguaci della vittima, di collaborare con i poliziotti bianchi. Ma sospettano subito di un bianco che ha sposato una giovane di colore la quale lavorava per la vittima, oppure dell'amante.

Un gioielliere greco uccide due giovani neri che volevano rapinare il suo negozio. L'uomo afferma di aver sparato per legittima difesa, ma i dubbi non convincono Logan, Cerreta, Stone e Robinette.

Logan lavora con il suo nuovo partner Lennie Briscoe sull'omicidio di un uomo. Sospettano della moglie che da tempo subiva le molestie da parte della vittima stessa. La donna è assistita da un avvocato delle donne, vittime dalle violenze dei loro mariti. Stone e Robinette scoprono che il movente dell'omicidio è il gioco.

Briscoe e Logan indagano sulla strana morte di un'anziana ebrea, sospettando subito del marito, e apparentemente credono che si tratti di un suicidio assistito. Però scoprono il segreto dell'uomo, in passato aveva commesso molti crimini di guerra collaborando con i tedeschi all'epoca del nazismo. Stone cerca di capire chi è veramente quell'uomo.

Briscoe e Logan indagano sul duplice omicidio di due infermiere avvenute nel loro dormitorio. Il duplice omicidio ricorda quello avvenuto a Brooklyn, e i detective individuano un possibile sospetto, un uomo con problemi mentali, Stone e Robinette ritengono che il vero movente possa essere correlato con un'attività illecita di alcune infermiere. Inoltre, come se non bastasse, sorge un conflitto tra i procuratori di due contee di New York.

Briscoe e Logan indagano sulla strana morte di un ufficiale della marina, avvenuta durante una festa universitaria presumibilmente per emorragia cerebrale. I due scoprono la verità dalla collega della vittima, che era un omicidio e sospettano del capitano della Marina. Stone e Robinette non fanno altro che cercare di incriminarlo.

In una clinica per diabetici muoiono due persone, e altre quattro si ritrovano in coma per ipoglicemia. Briscoe e Logan pensano che i responsabili siano gli infermieri, ma poi emerge che i computer dell'ospedale sono stati contagiati da un virus, e i sospetti cadono su un giovane hacker, che voleva vendicare il padre, cieco a causa del diabete.

Briscoe e Logan indagano sull'omicidio di una ragazza sordomuta, ma sospettano subito del fidanzato, che non vedeva di buon occhio il fatto che lei volesse fare un'operazione per l'udito. Poi però i sospetti si concentrano sul titolare di un centro per sordomuti, con cui la vittima collaborava attivamente.

Briscoe e Logan indagano sul tentato omicidio di un senzatetto psicologicamente instabile. Si sospetta subito di uno degli abitanti del quartiere dove l'uomo viveva. Ma per Stone e Kincaid sarà dura incriminare una persona, che aveva agito per crudeltà contro la vittima, il quale attaccava lui e i suoi vicini.

Un ricco uomo d'affari viene sorpreso dalla polizia con l'auto piena di soldi. L'uomo allora confessa a Briscoe e Logan, che stava pagando il riscatto, perché suo figlio era stato rapito. I rapitori vengono subito individuati e scoprono che hanno subito dei precedenti. Stone e Kincaid scoprono che il ragazzo rapito aveva finto quel rapimento per i soldi.

Una donna denuncia la scomparsa di suo figlio neonato avvenuta in un taxi. Durante le indagini, Briscoe e Logan scoprono un giro di adozioni illegali in cui è coinvolta la madre, che sfruttava i genitori adottivi con la minaccia di non dar loro suo figlio.

In una giornata lunga e faticosa Briscoe e Logan affrontano tre casi molto diversi tra loro: in due di questi i colpevoli vengono arrestati e processati e il terzo, accusato ingiustamente viene ucciso in carcere mentre era in attesa del processo.

Briscoe e Logan indagano sull'aggressione di una giocatrice di tennis, avvenuta in uno spogliatoio e che ha portato alla rottura del polso. I due sospettano prima di una sua amica invidiosa, poi del suo fidanzato, poi del padre che è anche suo manager. Stone scopre che la ragazza era stanca di una vita troppo stressante, decidendo di organizzare l'aggressione.

Briscoe e Logan indagano sull'omicidio di un uomo giapponese, proprietario di un night-club a Tokyo, che era a New York per portare una cantante a esibirsi nel suo locale. I due sospettano di una giovane artista che aveva già lavorato con la vittima, venendo sottoposta a continue vessazioni. Ma McCoy crede che stia recitando la parte di una donna affetta da sindrome della donna maltrattata.

In seguito all'omicidio di un poliziotto, Briscoe e Logan portano alla luce una vecchia storia di molestie sessuali, compiute da un parroco del luogo nei confronti dei bambini della sua parrocchia. Tra questi c'è anche la vittima che era anche amico di Logan. Il parroco, uscito dalla Chiesa e apparentemente marito e padre di famiglia, è sospettato di omicidio, ma McCoy scopre che la vittima si è suicidata.

Briscoe e Curtis indagano sulla rapina in una gioielleria dove viene ucciso un poliziotto e sequestrato un uomo. Mentre i detective cercano l'uomo rapito, uno dei due rapinatori viene rintracciato, ferito da una pallottola vagante durante la rapina.

Durante un'indagine Green uccide un sospettato. La commissione Affari Interni apre un'inchiesta.

Dalle indagini sull'omicidio di Charles, dirigente di un ente di beneficenza, la polizia risale ad uno scambio di favori che coinvolge il governatore.

La squadra indaga su un corpo ritrovato in un parcheggio che risulta essere quello di un giovane veterano di guerra. Le indagini portano a un professore di legge che lavorava per il Dipartimento della Giustizia.

Una detective della scientifica viene uccisa nel suo appartamento e i primi sospetti cadono sul suo fidanzato. Tuttavia, il caso si ricollega, tramite il DNA raccolto sulla scena, all'aggressione subita da una giornalista.

Stavolta la squadra indaga sull'omicidio di un dottore il cui cadavere viene ritrovato in una chiesa. Si scopre che la vittima praticava aborti ben oltre il limite di tempo consentito dalla legge.

Una giovane donna viene trovata morta nel suo appartamento. Il video della sorveglianza evidenzia un collegamneto fra il delitto ed un cartello della droga.

Nel corso dello svolgimento di un'elezione, il corpo senza vita di un volontario viene rinvenuto con la scritta FED vergata sul suo torace. I detective sospettano inizialmente un movente di natura anti-governativa ma ben presto vengono a conoscenza del fatto che la vittima stava raccogliendo una serie di informazioni incriminanti sul conto dell'organizzazione.