Sarah, een oplichtster die levenslang op de vlucht is van haar fouten, is getuige van de zelfmoord van een onbekende persoon, die sprekend op haar lijkt.

Met een lichaam in haar auto en nergens om naartoe te gaan, is Sarah gedwongen om haar oplichtingspraktijken voort te zetten en 'Beth' een tweede kans te geven.

Sarah moet meer dan alleen politiewerk doen om het bestaan van de wezen te garanderen. Het volgen van de moordenaar zet haar reünie met haar dochter op het spel.

Sarah's zoektocht naar antwoorden wordt onderbroken door een uitstapje naar de buitenwijken. Alisons paranoia is doorgeslagen, waardoor de wezen gevaar lopen.

Sarahs acties zet de wezen tegen elkaar op. Paul probeert Sarahs bestaan te verdoezelen, terwijl Alison wraak neemt op haar vermeende begeleider.

Sarah krijgt een gemiste kans als Art ingrijpt. De wezen moeten beslissen om vrede te sluiten met hun makers.

Sarah vermoedt dat de meedogenloze professionele kloon Rachel achter de verdwijning van haar dochter zit en verklaart Rachel de oorlog.

Alison heeft het moeilijk met de dood van Aynsley en Cosima's symptomen verergeren. Ondertussen roept Sarah de hulp van Art in om Kira te vinden.

et de hulp van Cosima graaft Sarah dieper naar de oorsprong van het kloon-experiment en deze jacht leidt haar recht in het hol van de leeuw.

Cosima en Delphine ontdekken genetische afwijkingen bij het Dyad Institute, en Sarah werkt met tegenzin samen met Helena om Ethan Duncan op te sporen.

Felix neemt Tony in bescherming, een transeksuele kloon die arriveert met een cruciaal bericht over Paul. Ondertussen dringt de tijd voor een zieke Cosima.

Helena wordt ontvoerd; de Clone Club beraamt een plan om Sarah te redden; en Marion brengt vernietigende informatie over het kroonprogramma aan het licht.

Castor jaagt de clonen van Leda na voor oorspronkelijke weefselmonsters. Helena, die zwanger is en gevangen zit, wordt ondervraagt door een mysterieuze nieuwe slechterik. De jongens van Castor zijn ook aan het spelen, en wel met de bange jonge vrouw Patty. Een sexy wisseltruc moet Sarah en Art weer terug brengen op het spoor van Castor.

Leda en Castor zijn allebei op jacht naar het originele cloon-DNA. Mark en Gracie jagen nieuwe aanwijzingen na om de monsters te vinden die hen kan bevrijden, terwijl Art en Sarah bijeen komen om hen op te sporen. Ondertussen proberen Cosima en Scott meer te weten te komen over Castors biologie.

Sarah's lot hangt aan een zijden draadje als zij haar zus probeert te redden.

Paul ontdekt de waarheid over Coady's plannen voor Castore en heeft geen andere keus dan een gevaarlijk spel te spelen.

De meedogenloze en verraderlijke Rachel onderhandelt over haar vrijheid door Duncan's Moreau-boek te decoderen.

Kendall mag dan wel de sleutel zijn om Castor tegen te houden, de zussen blijken hun gevaarlijkste vijand te dwarsbomen.

Na twee maanden van respijt, wordt Sarah's zwaarbevochten toevlucht in IJsland verbrijzeld door een Neolution aanval. Eens te meer geforceerd om te vluchten, realiseert ze dat hoe ver haar familie ook loopt het nooit ver genoeg zal zijn.

Na het ontkomen van een Neolution aanval in IJsland, keert Sarah terug naar huis om een ongrijpbare nieuwe bondgenoot op te sporen. Ze volgt broodkruimels en onthult het volgend facet van de agenda van Neolution - het implanteren van gevaarlijk technologische apparaten in mensen. Echter zijn degene die ze achtergelaten heeft op hun hoede om hun schijn van normaliteit af te moeten staan. Terwijl Cosima worstelt met de verdwijning van Delphine, herbergen Alison en Donnie een zwangere en hongerige Helena. Ondertussen begeeft Felix, die zich als een buitenstaander voelt, zich op zijn eigen reis naar zelfontplooiing.

Sarah vormt een alliantie met een voormalige vijand in de hoop bij het hoofd van de Neolution te komen. Elders krijgen Felix en Donnie de opdracht van Alison om een Neolution fertiliteitskliniek binnen te vallen en Susan Duncan verlaat Rachel om een verwoestend besluit te nemen.

Wanneer Cosima toegeeft twijfelt of ze op tijd een remedie vindt om haar leven te redden, maakt Sarah een beslissing die Kendall blootstelt aan degene waar ze zich jaren voor schuil hield. Ondertussen werken Art en Felix samen om de naïeve kloon Krystal Goderitch te beschermen tegen zichzelf.

Alison krijgt een ultimatum van Duko nu Donnie gevangen zit. Cosima staat dichtbij een oplossing en mw. S zint op wraak om wat haar moeder is aangedaan.

Nieuwe bazen brengen de toekomst van Neolution in gevaar. Sarah gaat naar het eiland Cosima dat in gevaarlijk blijkt te zijn na een wetenschappelijke doorbraak.

Sarah kan met moeite overleven op het vijandige eiland, terwijl Cosima zich aanpast aan het leven in het dorp. Thuis staan hun familieleden voor nieuwe bedreigingen.

Na een ontmoeting met de mysterieuze P.T. doet Rachel Sarah een aanbod dat ze niet kan weigeren. Een oude bondgenoot verlaat haar schuilplaats om Kira te helpen.

Cosima twijfelt aan de loyaliteit van Delphine en ontdekt de waarheid over het 'wezen' dat het dorp terroriseert. Het wordt duidelijk wat Neolution van plan is met Kira.

Nu Kira's procedure steeds dichterbij komt, voert Cosima een race tegen de klok om P.T. te ontmaskeren. Rachel raakt helemaal van slag na een verontrustende ontdekking.

Sarah, Art en Helena leveren tijdens een dramatische confrontatie in het oude Dyad-gebouw een ultiem gevecht tegen Neolution.