Paige verdonnert Toby und Walter zu einer Paartherapie, da sich die beiden dauernd in die Haare kriegen. Außerdem erlaubt sie Ralph, mit Sylvester an den Strand zu fahren. Während die anderen außer Haus sind, hütet der Rest des Teams das Hauptquartier. Doch dann erschüttert ein mächtiges Erdbeben Los Angeles. Infolgedessen herrscht Überdruck auf den Gasleitungen und ein Stadtteil droht in die Luft zu fliegen. Team Scorpion muss helfen, obwohl es in der ganzen Stadt verteilt ist.

John Pandova wendet sich mit einem ungewöhnlichen Anliegen an Team Scorpion: Bei Bauarbeiten in Vietnam sind Uniformreste einer verschwundenen US-Truppe gefunden worden. Die Genies sollen nun einen Bodenscanner so optimieren, dass binnen zwei Tagen aufgeklärt werden kann, ob dort noch sterbliche Überreste der Männer liegen. Falls ja, würden sie in die USA überführt. Vor Ort gestalten sich die Arbeiten schwierig, denn ein heftiger Tornado zieht auf.

Team Scorpion wird nach Tschernobyl gerufen: Der Beton-Sarkophag des Reaktors ist brüchig und schützt das Corium im Inneren des Reaktors nicht mehr hinreichend. Sobald die Elemente auf das hochgradig radioaktive Material treffen, entstehen giftige Wolken, die sich in Regen entladen und so ganz Osteuropa verseuchen können. Die Genies sollen sich eine neue Dichtung einfallen lassen – doch vor Ort geht ein Rundflug über das Gelände schrecklich schief.

Das Team Scorpion soll in einem Biodome, das die auf dem Mars herrschenden Lebensbedingungen simuliert, wieder für Strom sorgen. Walter, Toby und Happy machen sich auf den Weg in die Wüste, um die nötigen Reparaturen vorzunehmen. Doch das gestaltet sich äußerst schwierig, denn die Anlage ist derart veraltet und defekt, dass schließlich sogar der Reaktor explodiert. Vor Ort steigen plötzlich die Temperaturen lebensgefährlich – und die Sicherheitstür kann nicht geöffnet werden.

Nach einer Steinlawine benötigt ein Such- und Rettungsteam in New Mexico Unterstützung bei den Aufräumarbeiten. Mit Happys neu entwickelter Winde soll Team Scorpion die Zugangsstraße zum Tal von den Felsbrocken befreien, als sie Zeuge eines Flugzeugabsturzes werden. Während Happy und Toby erste Hilfe leisten, machen sich Paige und Walter auf die Suche nach einem weiteren Unfallopfer. Doch an der Absturzstelle erwartet sie eine böse Überraschung.

Für den Fall eines Weltuntergangs hat die Firma SafeCorp einen Bunker gebaut. Der Zutritt erfolgt über eine spezielle Computersoftware, die von Team Scorpion getestet werden soll. Der Bunker selbst wird von einem Sicherheitssystem mit künstlicher Intelligenz gesteuert. Toby ist deprimiert, weil Florence die Truppe als Chemieexpertin begleiten soll, während er nicht mitkommen darf. Trotzdem schleicht er sich unerlaubt in den Luftschutzraum und gefährdet damit das gesamte Team.