Kana continue de suivre son instinct quand elle détecte le moindre parasite autour d’elle, allant à sa rencontre en espérant retrouver Shin’ichi. Le garçon persiste à lui faire comprendre qu’elle court à chaque fois un grave danger.

Après la mort d’un de leurs congénères, le groupe de parasites mené par Hirokawa décide de contre-attaquer. Shin’ichi et Migi essuient ainsi l’attaque d’un parasite inhabituel, Miki.

Les opérations du groupe de Hirokawa se sont soldées par un échec, et certains s’en prennent alors à la menace que représente Reiko Tamura. Attaquée par trois congénères, elle emploie une stratégie hors du commun.

Reiko Tamura trouve Shin’ichi dans le parc où est mort Kuramori. Elle lui expose ses conclusions sur l’existence des parasites, une question à laquelle elle a longuement réfléchi. Rapidement, la police les encercle…

Confronté au tueur en série Uragami, Shin’ichi parvient de justesse à brouiller les pistes. Par ailleurs, les autorités mettent en place une opération d’élimination des parasites qui occupent la mairie de Fukuyama-Est.

L’armée commence son opération d’extermination en faisant évacuer la mairie par petits groupes. Toutefois, le pouvoir de télépathie des parasites permet à Hirokawa de comprendre la situation et de répliquer aussitôt.

L’opération militaire tend vers sa conclusion : au prix de lourdes pertes humaines, la plupart des parasites ont été éliminés. Seuls restent Hirokawa, encerclé par plusieurs soldats, et Gotô, dont les capacités hors normes vont donner du fil à retordre à ses assaillants.