Tras recuperar a Mitsuki y resolver el incidente con la Roca, los jóvenes protagonistas se preparan para recibir su castigo por lo ocurrido.

Mientras Tosaka intenta azuzar a Juugo para enfrentar ambos sellos malditos, Sarada y Karin buscan la forma de impedir que los gansos propaguen el sello al iniciar la migración.

Boruto, Mitsuki y Sarada necesitan completar su misión en la prisión, pero el guardia responsable de la prisión, Benga, no les hará la vida más fácil ... ¡Para proteger a Kokuri, necesitan que se quede en su celda!

El equipo 7 ha llegado a un centro de investigación de alta tecnología junto con Katasuke. Allí, terminan encontrándose con algunas caras conocidas. La misión ha terminado sin incidentes y Boruto está listo para regresar a casa. Sin embargo, deben hacer más. Boruto y sus amigos terminan cooperando en una prueba de funcionamiento de una herramienta Scientific Ninja que está en desarrollo. Boruto no está contento al principio, pero a medida que continúa la prueba, sus sentimientos comienzan a cambiar. Mientras eso sucede, el Equipo 7 recibe una nueva asignación urgente del Hokage.

En medio de una feroz batalla, los temores de Kawaki se hacen realidad, y Momoshiki toma el control de Boruto. Kawaki observa como Boruto abruma a Code como Momoshiki. Entonces Naruto llega con Shikamaru. Kawaki está preocupado por la seguridad de Naruto como uno de los objetivos de Code, pero a pesar de sus deseos, Naruto se enfrenta a Code como el Hokage. Desafortunadamente, Code toma a Shikamaru como rehén, y en su deseo de resolver su rencor, Momoshiki se une a él. Naruto se enfrenta a una situación extremadamente peligrosa.