고스트 사건의 빈도와 장소가 점점 확대되고 피해자도 늘어남에 따라 사태의 심각성을 인지한 나루토는 경무국 차원의 본격적인 조사를 명령한다. 그러자 꼭 고스트 사건을 자기 손으로 해결하고 싶어 하는 보루토는 더욱 조바심이 난다. 꾀병을 빙자해 결석 사유서까지 제출하면서 고스트를 찾아 헤매는 보루토와 아이들. 하지만 허술한 결석 사유서를 작성해서 낸 미츠키 때문에 보루토와 아이들의 꾀병이 탄로나고 마는데...

나루토는 자기 아버지가 어디 있는지 알 수 있을 거라며 호카게 집무실로 찾아간 사라다. 그런데 사스케를 만나러 간다는 나루토의 말을 문 밖에서 엿듣고,부랴부랴 짐을 챙겨 나루토를 따라 떠날 준비를 한다.드디어 나루토가 마을을 떠나고 사라다는 쵸쵸를 이끌고 미행을 시작하려던 찰나,보루토가 뒤늦게 나루토에게 줄 도시락을 가져오는 것을 본다.그러자 도시락을 전달하는 것을 구실로 삼아 나루토를 뒤쫓기로 하고도시락을 대신 전해 주겠다고 보루토에게 말하는데...

우치하 신의 은신처를 찾아서 가는 내내 사라다는 아빠의 뒷모습을 보며 만감이 교차하는 복잡한 심경에 빠진다. 하지만 이내 지금은 엄마를 구하는 데만 정신을 집중하자며 마음을 다잡는다. 한편, 우치하 신은 우치하 이타치의 뜻을 이어서 아카츠키를 부활시켜서 세상에 또다시 전란을 불러일으킬 거라며,우치하라는 성을 물려받을 사람은 자기여야 한다고 주장한다. 그러자 지금껏 우치하 신의 동태를 몰래 살피고 있던 사쿠라는 클론들 외에 우치하 신과 같은 패거리는 없다는 걸 간파하고 우치하 신만 처리하면 모두 해결된다는 확신이 들자 마침내 공격을 가하는데...