Dopo la morte di una ragazza di 16 anni della comunità, Mary cerca conforto nella fede ancor più di prima, ma inizia a dubitare dell'esistenza di Dio; esce così con sua madre Connie e si ubriaca non potendo fare a meno di chiedersi se al posto di quella ragazza ci fosse stato uno dei suoi figli. Sheldon, molto preoccupato anche perché la madre smette di andare in chiesa e di fare la consueta preghiera prima di mangiare, le parla di quante cose casuali rendano esistente la vita sul pianeta Terra, affermando che lei è la madre migliore che un bambino come lui potrebbe avere e che tale fortuna è la dimostrazione che esiste veramente un potere superiore; grazie a queste parole Mary ritrova la fede.

Sheldon, avendo ricevuto una richiesta di aiuto per i compiti da parte della sorella, ispirato dal film 1999 - Conquista della Terra che sta guardando, decide di creare una razza di super uomini ai suoi ordini, partendo da Missy; dopo essere riuscito a spiegarle le frazioni però, l'interesse della gemella scema subito e il ragazzino decide quindi di cercare aiuto nei libri della biblioteca. Dopo un fallimentare tentativo applicando le teorie di Socrate, su consiglio della signora Hutchins applica delle teorie comportamentali che prevedono punizioni e ricompense, ma, quando taglia un capello della bambola preferita di Missy, ottiene solo un pugno in faccia dalla gemella. Nel frattempo Georgie, ancora invaghito di Veronica, inizia a frequentare il gruppo di preghiera della madre a cui adesso partecipa anche la compagna di scuola e arriva addirittura a farsi battezzare insieme a lei; durante la funzione però la bacia e riceve, come il fratello, un pugno in faccia. Oltre alle conseguenze fisiche, i due fratelli ottengono però anche una ramanzina e un castigo da parte della madre.