Chise et Elias se font à la vie au Collège, tandis que Philomela, toujours un peu à l'écart des autres élèves, est convoquée par sa famille.

L'heure est aux explications familiales, que ce soit entre Lucy et son frère, ou Alice et Renfred. Le Collège traverse par ailleurs une période compliquée où d'autres magiciens semblent vouloir nuire aux nouveaux élèves.

Suite aux diverses attaques mystérieuses, la directrice décide d'empêcher toute venue et départ du Collège. C'est dans ce contexte que Chise et ses camarades rencontrent Fabio Zaccheroni, un professeur suppléant peu commode.

Philomela est dans un état très affaibli et se fait assister par Alcyone et tous ses camarades. En parallèle, Mariel et Isaac sont à la recherche du grimoire perdu.

Le Collège est toujours confiné et ravive les tensions entre jeunes élèves, notamment entre Rian et Philomela qui se connaissent depuis des années. En parallèle, un mystérieux rhume semble se propager.

Tandis que Philomela s'isole de plus en plus, les victimes du grimoire interdit augmentent au sein du Collège pourtant à huis clos, jusqu'au moment où Chise croise une victime qui semble convoiter son énergie magique.

Rian cherche désespérement à approcher Philomela qui s'est enfermée dans sa chambre. Chise cherche également à la rassurer et à lui venir en aide, mais l'affaire du grimoire au sein du Collège toujours à huis clos prend une dimension de plus en plus angoissante.

Philomela est la fameuse coupable en possession du grimoire et a pris une forme difficile à combattre pour l'ensemble du personnel du Collège, prêts à en découdre avec elle. Chise veut absolument lui venir en aide et la sauver, contre l'avis du corps professoral.

Chise a décidé de partir au manoir des Sargent pour sauver Philomela, mais la voilà confrontée à une déesse bien étrange. En parallèle, Alcyone semble petit à petit se souvenir des parents de Philomela.

Chise et quelques camarades du Collège arrivent au manoir des Sargent pour venir en aide à Philomela. Avant de plonger dans les souvenirs de cette dernière, les jeunes magiciens et sorciers vont devoir faire face à la loup-garou femelle intimement liée au massacre des Webster.

Au travers de plusieurs flashbacks, on découvre les véritables souhaits de Lizbeth, la grand-mère de Philomela. Comment Chise et ses amis vont-ils pouvoir sauver cette dernière ?

Chise est parvenue à sauver Philomela des griffes du grimoire et de sa grand-mère, qui invoque à son tour un dieu que Elias, Chise et leurs amis vont devoir vaincre. Mais Alcyone, le garde du corps de Philomela, semble avoir un dernier sortilège en elle.