性格冷漠，对周围的事毫不关心的六条壬晴（钉宫理惠 配音），看似只是一个平凡的高中生，但其体内却蕴含着忍者世界最强的秘术“森罗万象”。这种能力遭到了忍者世界诸多人的觊觎，更引来了伊贺忍者部落的集体出动，誓把壬晴带回挖掘出其体内的秘术。与此同时，壬晴的英语老师云平（浪川大辅 配音）和其同学相泽虹一（日野聪 配音）则是万天之里的忍者，被分配的任务就会保护壬晴的安全。一场关于“森罗万象”的争夺就此展开，各色人物也将悉数登场。而壬晴想要过回平常人的生活，只有一个办法，就是成为传说中的隐王……

　　本片改编自镰谷悠希在《月刊gfantasy》上连载的同名漫画，目前连载已完结。

닌자의 세계뿐 아니라 바깥 세계마저도 지배할 수 있다는 비술 '삼라만상'. 그 비술을 몸 속에 봉인하고 있는 미하루는 아이라고 하기엔 너무나도 주변에 무관심한 중학생이다. 그런 미하루의 몸 속에 잠들어 있던 삼라만상이 깨어나면서 전국의 모든 닌자들이 그를 향해 덤벼들기 시작한다. 부모님과 관련된 슬픈 과거가 있는 미하루와 그의 어린 시절과 연관된 듯 보이는 쿠모히라 선생님, 그리고 미하루를 차지하기 위해 집결하는 이가의 닌자들. 미하루를 지키려는 자들과 그를 빼앗으려는 자들이 서로 격돌하기 시작하는데...

In the shadows of this world, ninjas fight for control of an ancient technique which holds untold strength. This coveted power dwells within apathetic Miharu, a fact the guy really couldn't care less about - until the rival clans bring their battle to him. Now, he must choose a side if he hopes to survive - but when conflict is waged in secret, friend and foe prove difficult to tell apart.

Rokujo Miharu est un garçon comme les autres, mais il a en lui une technique secrète très puissante appelée « Shinrabanshō » convoitée par de dangereux ninjas.

Kouichi Aizawa crée un club de ninjas dont le professeur Kumohira est responsable, tous deux sont des ninjas qui cherchent à protéger Miharu des menaces qui pèsent sur lui. Ils le forcent à faire partie de leur club de ninja pour qu'il apprenne à se défendre afin qu'il devienne le seigneur de Nabari, le monde des ninjas.

Rokujou Miharu verfügt über die Fähigkeit des »Hijutsu«, eine verborgene Technik, die in seinem Inneren lebt. Dieses Hijutsu ist die Kraft der Schöpfung. Viele Ninjaclans wollen diese Technik lernen, weil derjenige, der sie besitzt, der Herrscher der Ninjawelt ist. Rokujous Klassenkamerad Kouichi Aizawa hat zusammen mit seinem Englischlehrer Thobari Kumohira einen Club namens »Nindou« gegründet. Beide sind in Wirklichkeit Ninja und versuchen erfolglos Rokujou zu überreden, dem Club beizutreten. Doch nachdem er von einer Gruppe Ninja angegriffen wird, entscheidet er sich um und tritt dem Club doch bei. Um zu überleben, muss er der Herrscher von Nabari werden. Ob er das wirklich schafft?

Miharu Rokujo è uno studente delle medie nel cui corpo è racchiusa la misteriosa “Arte Segreta”, la Shinrabansho, la somma di tutte le tecniche create dai ninja nel corso della storia. L’anime è ambientato ai giorni nostri, in un’epoca in cui i ninja si sono ritirati in un mondo segreto conosciuto come “Mondo di Nabari”, mantenendo una seconda identità nella nostra realtà. Uno dei villaggi più potenti di Nabari è quello di Iga, guidato dal clan Kairoshu, che mira al potere assoluto dello Shinrabansho, con cui dominare l’intero Universo. I suoi appartenenti puntano a rapire Miharu per estirparne l’Arte Segreta, ma il ragazzo è protetto, a costo della loro vità, da alcuni ninja del villaggio di Banten..

汝、隠の世の王となれ 忍の世界＝「隠（なばり）の世」が生んだ最大の秘術・森羅万象。強大な力を秘めた謎多きその術を身体に刻まれた少年・六条壬晴をめぐり現代に生きる忍たちの戦いが今、始まる…！

Nabari no Ou se passa no Japão moderno, contando a saga de um grupo de ninjas. A história gira em torno de Miharu Rokujou, um garoto comum, pouco interessado pelo mundo que o cerca. Por esse motivo, ele procura levar a vida no seu próprio ritmo. Entretanto, devido a uma desconhecida técnica de batalha chamada de Shinra Banshou, o cotidiano do jovem não será nada tranquilo. Por algum motivo misterioso, essa poderosa habilidade está presa dentro do corpo de Miharu, e além da força incontestável, o Shinra Banshou é visado pela maioria dos ninjas existentes.

Тихий, апатичный, но мило выглядящий и часто этим пользующийся, 14-летний Рокуджо Михару (Miharu Rokujo) – носитель хиджуцу «Шинрабаншо», могущественной силы ниндзя, которую многие кланы жаждут заполучить. Тот, кто овладеет «Шинрабаншо», станет правителем мира ниндзя Набари.

Одноклассник Михару, Айзава Коичи, и их школьный учитель английского языка, Кумохира Тобари Дюрандал, принадлежат к клану ниндзя Бантен и просят Михару позволить им защищать его, ведь «Шинрабаншо» просыпается, и скоро Михару будет в опасности. Хотя Михару это и не интересует, но он вынужден согласиться на их предложение, на него происходят одно нападение ниндзя за другим. И вскоре к их группе присоединяется очаровательная блондинка-самурай Шимизу Раймэй.

Так с каждым днем все сильнее и сильнее Михару погружается в мир ниндзя Набари.

Rokujou Miharu es un estudiante de instituto que vive en su propio mundo. Sin embargo, dentro de el, estaba al acecho el ultimo poder de Nabari, la "Omnipotencia". Para poseer tal arma suprema, el clan Iga jura llevar a Miharu a su pueblo. Por otro lado, el profesor de ingles de Miharu, Kumohira sensei, y el compañero de clase, Kouichi, pertenecen a los Banten ninjas cuya mision es proteger a Miharu. Una guerra sobre la propiedad de la "Omnipotencia" ha comenzado. Para sobrevivir, Miharu debe entrar en el mundo oculto de Nabari, y convertirse en rey.