La police du Texas découvre à Gallup, une paisible bourgade, deux corps atrocement mutilés. Après enquête, il semblerait que les auteurs de ce carnage soient des chauves-souris. Sheila Casper, éminente spécialiste, et son assistant Jimmy sont appelés d'urgence par le gouvernement, alors que les attaques et les victimes se multiplient. C'est alors que l'énigmatique professeur McCabe avoue avoir effectué des manipulations sur des spécimens de chauves-souris qui se sont échappés.

À l'occasion de leurs vacances d'été, huit étudiants partent en croisière à bord d'un bateau. L'un d'eux, Duncan, trouve dans les marécages un nid plein d’œufs. Il détruit la couvée mais conserve un des œufs qu'il rapporte sur le bateau. Il ne sait pas qu'il a réveillé la colère d'une mère crocodile, prête à tout pour récupérer le seul de ses petits rescapé.