Flipper vient à la rescousse lorsqu'un sous-marin est pris au fond de l'océan, piégeant son occupant qui manque rapidement d'air.

Pour offrir un habitat aux poissons, Porter Ricks jette des épaves d'automobiles à la mer. Lorsque Sandy et Bud partent plonger en compagnie de Flipper, ils découvrent une voiture portant des impacts de balles...

Flipper sauve un médecin de la marine empoisonné par une piqûre de poisson.

Kathryn Terrence rend visite à Porter Ricks au moment où il s'apprête à faire une partie de water-polo...

Mike Beldon, un garçon de la ville, rend visite aux Ricks, dans le Parc de Coral Key. Il réussit à convaincre Sandy de l'emmener faire de la plongée au milieu d'une épave...

Dorrie Stone, un pêcheur local sans scrupule, s'empare de Flipper et prétend que le dauphin lui appartient...

Un vieil homme remplit la tête de Bud d'histoires héroïques, mais son père l'avertit que toutes les histoires ne sont pas nécessairement vraies. Les circonstances obligent Bud à s'en rendre compte alors, mais il veut être un héros en retrouvant les braconniers qui ont failli tuer son père.

Sandy et Bud doivent transporter du matériel sur une île, pour une étude secrète. Flipper les accompagne...

Monsieur Marvello a été mis à la porte du cirque Parker Bros. En voyant Flipper, il a une idée. En utilisant ses talents de ventriloque, il pourrait faire croire que Flipper sait parler...

Flipper vient en aide à Alexis Demopoulos, un vieux pêcheur d'éponges. Ce dernier voit en Flipper la réincarnation de son frère...

Linda Granville, championne de ski nautique, découvre la photo que Sandy a prise d'elle en pleine compétition. Depuis, un accident l'a paralysée...

La députée Helen Browning visite le Parc national de Coral Key afin de décider de sa fermeture éventuelle...

Sandy et Bud Ricks tentent une dernière fois de convaincre la députée Helen Browning de préserver le Parc de Coral Key...

Après que Hap ait raconté au garçon une grande histoire sur la capture d'un poisson, les garçons l'ont convaincu d'aller pêcher avec eux le lendemain. Cependant, il y a un danger à proximité sous la forme d'une réunion père et fils.

Informés d'un vol de bateau dans le Parc de Coral Key, Sandy, Bud et Flipper décident de mener leur enquête...

Le parc est envahi par les chercheurs de trésors lorsque Bud et Hap sont excités par un doublon trouvé par Flipper.

Flipper sauve une femme de la noyade. Porter Ricks contacte son mari et, lorsqu'il entend l'histoire de sa femme, décide de faire une autre étude pour voir si Flipper peut vraiment sauver des vies.

Po dit à Bud de garder le flipper en toute sécurité pendant que lui et Sandy accompagnent le Dr Tollner dans une expérience anti-requins, mais Bud désobéit.

Flipper a trouvé de l'argent sous l'eau et montre une partie de ce trésor à Bud. Il lui indique l'endroit où il a fait sa trouvaille...

Bud et Flipper découvrent l'épave d'un galion espagnol...

Un dauphin blanc rare est découvert par Flipper et par un homme avide d'argent qui veut le capturer. Les garçons et Porter Ricks se battent pour trouver un moyen de sauver le dauphin, sachant que s'il reste libre dans l'océan, sa vie resterait en danger. Mais pourront-ils le sauver à temps ?

Porter reçoit un avertissement indiquant que des produits chimiques toxiques sont déversés quelque part, mais ils ne savent pas où. Pendant ce temps, une course de natation est sur le point de commencer. Sandy est ravie d'être dedans. Mais des complications surviennent lorsque Porter découvre les produits chimiques toxiques et meurt presque.

Bonnie McCoy est de retour, cette fois avec son père et différents animaux. Après leur naufrage, Porter les sauve. Mais ils ont un homme après leur éléphant et il est déterminé à le récupérer et à l'envoyer dans un zoo.

Bonnie demande à Sandy et Bud de l'aider à faire entrer l'éléphant et le chimpanzé dans un cirque, mais pour y arriver, ils doivent emprunter des sentiers dangereux.

McCoy trouve les 200 $ pour payer Samson, mais est bientôt arrêté et accusé d'avoir volé la mallette de Samson. Les enfants doivent amasser suffisamment d'argent pour la caution ou McCoy perdra son nouvel emploi.

Bud souhaiterait jouer les héros comme dans les séries télévisées. L'occasion va se présenter lorsqu'il se retrouve à cacher Tina, une petite fille de huit ans qui prétend s'être enfuie d'un tortionnaire. Bud accepte de l'emmener sur son radeau mais l'aventure va frôler la tragédie...

Après qu'un plongeur a été retrouvé mort, Porter Ricks ferme le parc et ordonne que personne ne soit autorisé à entrer dans l'eau pendant qu'une enquête sur la mort inexpliquée se poursuit. Bud, cependant, ne pense pas que cela signifie qu'il ne peut pas être dans un bateau en pleine mer. Mais quand la même chose arrive à un plongeur, il doit ramener l'homme et la femme à terre avant que la marée ne monte !

Flipper est attiré par des sons provenant d'un groupe de dauphins en pleine mer. Ni Bud ni Sandy ne pourront l'empêcher de partir, le dauphin suivant son instinct. Très vite, les garçons vont s'apercevoir que ces bruits proviennent d'un sous-marin piloté par le docteur Kellwin, qui souhaite capturer Flipper pour mener des expériences dans un centre de recherches...

Lorsque Flipper accorde toute son attention à l'actrice, Bud devient jaloux. Même après que son père l'ait mis en garde contre le "monstre aux yeux verts", Bud prend toujours les choses en main.