Зета е робот за убийства и диверсии, но се разбунтува срещу своето програмиране. Властите мислят, че някой от враговете им го е препрограмирал и се опитват да го заловят, за да го препрограмират отново. Зета обаче бяга и опитва да намери създателите си, в което му помага едно момиче - сираче.

La historia se desarrolla a partir del año 2040. Cuenta la futurista aventura de un robot sintoide de avanzada tecnología que era utilizado por el gobierno de los Estados Unidos como arma de infiltración y eliminación. En una misión de infiltración, Zeta rompió el protocolo al no eliminar a su objetivo tras descubrir que era inocente, es catalogado como fugitivo y desde entonces huye de los agentes de la Agencia Nacional de Seguridad, los cuales desean capturarlo para reprogramarlo. Zeta desea encontrar a su creador, el Dr. Selig y entender por que él es capaz de poseer voluntad propia; en el camino se encontrara con personas que lo ayudarán en su búsqueda como son Ro, quien lo acompaña siempre y Batman (Terry McGinnis) (solo en dos episodios de la serie Batman del Futuro).

En este spin-off de Batman Beyond, Zeta es un robot de infiltración experimental equipado con armamento y un autoproyector holográfico que le permite asumir cualquier identidad. Desafortunadamente, su programación también evoluciona hasta el punto en que adquiere sensibilidad y conciencia. Huye del gobierno de los Estados Unidos, que cree que ha sido reprogramado por una potencia extranjera. En la huida, Zeta se encuentra con Rosalie "Ro" Rowan, una huérfana de la calle que es buscada por la ley. Inicialmente fascinada por las habilidades criminales de Zeta y la tarjeta de crédito imposible de rastrear de efectivo ilimitado que tiene, ella se une a él. Los dos forman rápidamente una verdadera amistad y se embarcan en una aventura por todo Estados Unidos para encontrar a los padres de Roe y al creador de Zeta, quien puede demostrar que Zeta está actuando por su propia voluntad. La NSA, dirigida por el agente Bennett, los persigue.

Zeta est un androïde d'infiltration et de nettoyage de type Terminator. Autant dire que ses concepteurs l'ont équipé de toutes les technologies pour tuer. Mais un grain de sable vient gripper le système, car son père spirituel avait inclus dans sa logique de penser les graines du libre arbitre… Et donc, Zeta décide de se confier à son libre arbitre plutôt qu'à l'agence qui l'emploie. Du coût, l'agence le poursuit car il est la preuve d'une organisation et d'un produit qui ne devraient pas exister. Tandis qu'il recherche désespérément ses parents ou plutôt ses concepteurs, il nous entraine dans son aventure en compagnie de deux autres personnages turbulents, Ro la petite blonde et un autre adolescent de génie, Bucky, lui aussi tourmenté.

Follow the futuristic adventures of Zeta, a renegade government-designed robot, and Ro, his 15-year-old streetwise companion.

Projeto Zeta conta a história do sintozóide (um robô com forma humana), programado para ser uma unidade de infiltração para matar em nome do governo americano, porém ao abortar uma missão ele passa a ser perseguido pela NSA (Agência de Segurança Nacional, sigla em inglês), liderada pelo agente James Bennet, que o considera um traidor. Em meio à fuga, Zeta conhece Rosalie Rowen, uma adolescente órfã e delinqüente, que passa a ser sua melhor amiga, e ambos saem em busca de Eli Selig, arquiteto do “Projeto Zeta” e único que pode provar sua inocência.