A raíz de un brote repentino de psicoquinesia en el 0,1% de la población, una rápida transformación barrió el mundo. La capacidad de Dios, para manipular la materia a distancia volvió muchos jugadores con energía a la violencia, la incitación de un largo período de agitación. Finalmente, después de una época caótica forma por el ascenso y la caída de los regímenes opresivos, los seres humanos psíquicos fueron capaces de lograr una paz frágil mediante el aislamiento de su sociedad, creando un nuevo mundo sujeto a las normas complejas.

En la ciudad de Kamisu 66, 12 años de edad, Saki Watanabe acaba de despertar a sus poderes y es relevado a reunirse con sus amigos, la traviesa Satoru Asahina, el tímido Mamoru Itou, la alegre Maria Akizuki, y Shun Aonuma, un misterioso chico Saki quien admira en Sage-Academy, una escuela especial para los psíquicos. Sin embargo, el malestar se perfila como Saki comienza a cuestionar el destino de aquellos que no pueden despertar a sus poderes, y los niños comienzan a involucrarse con asuntos secretos, como los gatos rumoreado Tainted dijo a secuestrar a los niños.

Shinsekai Yori cuenta la historia única de mayoría de edad de Saki y sus amigos en su viaje para convertirse en sus roles en la supuesta utopía. La aceptación de estas funciones, sin embargo, no podría venir fácil cuando se enfrentan a las verdades oscuras e impactantes de la sociedad, y la inminente caos nacido del nuevo mundo.