Lamune raconte l'histoire de Kenji Tomosaka qui vient d'emménager avec sa famille au bord de la mer. C'est ainsi qu'il fait la connaissance de sa voisine Nanami Konoe. Présenté sous forme de flash-back, cet animé nous fais vivre le quotidien ordinaire de deux adolescents et de leur entourage dans des situations de la vie courante. La série commence a l'approche de l'été, cependant c'est un été un peu "spécial" qui s'annonce pour nos deux protagonistes. Un lien étrange va peu à peu s'installer entre Kenji et Nanami au fil des saisons...