Klay, a Gen Z nursing student who wakes up and finds herself in the world of Jose Rizal’s novels Noli Me Tangere and El Filibusterismo.

Un groupe de 6 adolescents décide de passer leur week-end dans un parc d'attractions. C’est en montant dans un train fantôme que leur destinée va basculer, et ainsi une fracture spatio-temporelle les projette dans un univers médial fantastique peuplé de sorciers maléfiques, de dragons volants et autres monstres légendaires ! Ils font alors connaissance d'un magicien, le Grand Maître, qui va les guider dans leur quête par ses apparitions aussi brèves que spontanées pour leur soumettre de petites énigmes qu'ils comprennent rarement sur le coup, mais qui les sauvent souvent au dernier moment.

Hitomi, jeune lycéenne possédant le don de cartomancie, est téléportée malgré elle sur la planète Gaïa où elle fait la connaissance du roi Van Fanel du royaume de Fanélia et du chevalier Allen Schezar du royaume d'Astria. Tous deux luttent contre l'empire Zaïbacher à bord de leurs guymelefs : Escaflowne et Sheherazade.

Hitomi se retrouve alors au cœur du conflit.