革命历228年，冬。从属于E.U.联盟联军的W Zero部队中尉阿基德（入野自由 配音）迎来了与哥哥——布里塔利亚帝国圣米迦勒骑士团的团长信·修加·夏音度（松风雅也 配音）的决斗。成濑幸也（松冈祯丞 配音）制造的炸弹虽然摧毁了帝国1/3的战斗力，但是他们仍然面对着为数众多的对手。敌我差距悬殊，获胜希望渺茫。关键时刻，骑士团下的阿修罗队队长阿修雷・阿修罗（寺岛拓笃 配音）临阵倒戈，加入阿基德他们一方。决战前夕，阿基德剪下自己的一撮头发，交到蕾拉·玛露卡尔（坂本真绫 配音）的手中。历经战火的洗礼，他们之间的关系悄然发生着改变。希望还是绝望，前路迷茫……

信暴走的Geass。阿基德決心和哥哥進行最後的戰鬥。由於成瀨幸也放出了的炸彈，不列顛軍減少到了三分之一，不過包圍了的wZERO部隊處於壓倒性地不利的狀況的事實不變。在那裡身為敵人的阿修雷作為新的朋友加入。在最後一場戰鬥之前，阿基德把自己的頭髮剪掉交給了蕾拉。

The Ark Fleet has been destroyed, and a significant number of the enemy's troops have been wiped out due to its crash landing. As the remaining forces of the Holy Order of Michael regroup in order to launch a final assault on Weiswolf Castle, the wZERO unit, along with their new ally Ashley Ashra, stand ready to intercept them. Meanwhile, with his Geass out of control, Shin moves to erase his younger brother's existence once and for all. But Akito, having promised Leila that he will come back alive, refuses to accept such a fate, and the two clash in their final battle.

« Mon objectif est détruire ce monde ! » Shin perd le contrôle de son Geass. Akito est résolu à l'affronter dans un ultime combat fratricide. L'unité wZERO a certes réussi à réduire les troupes euro-britanniennes de deux tiers grâce à la bombe larguée par Yukiya, mais elle est toujours en position de faiblesse, recluse dans le château de Weisswolf. Ashley, un ancien ennemi de l'unité, change de camp et vient leur prêter main forte. Avant de partir pour l'ultime combat, Akito coupe sa tresse et la donne à Leila. Quand les âmes sont unies, le secret de l'avenir est mis à nu. Le futur qui les attend sera-t-il celui de l'espoir ou du désespoir ? La bataille de la destinée touche à sa fin. Voici venir la conclusion de Code Geass - Akito the Exiled !

Showdown im Bruderkampf zwischen Akito und Shaing.

La storia degli si svolge nell'anno 2017 a.t.b., a cavallo fra la prima e la seconda serie, quando il Giappone comincia ad accusare colpi dopo la sparizione e la presunta morte di Zero, alter ego di Lelouch a capo dei Cavalieri Neri. La trama prende piede nella superpotenza Euro Universe, la quale, soverchiata dall'aggressiva campagna militare del Sacro Impero di Britannia, spera di cambiare le sorti della guerra formando una speciale divisione conosciuta come wZERO, nella quale milita un promettente pilota di Knightmare Frame, Akito Hyuga. Altro personaggio rilevante sarà Leila Malkal, ex aristocratica britanna votatasi alla causa dell'E.U., la quale capeggia il gruppo di ribelli Wyvern, composto da giovani giapponesi. I Wyvern si lanciano incautamente sul campo di battaglia, dove le possibilità di sopravvivenza sono incredibilmente scarse. Loro combattono per la propria libertà e per una "casa" in cui tornare.

聖ミカエル騎士団の総帥シン・ヒュウガ・シャイングのギアスが暴走する中、wZEROのパイロット・日向アキトは兄との戦いを決意する。成瀬ユキヤの活躍によりユーロ・ブリタニア軍は3分の1に激減。しかし、本拠地ヴァイスボルフ城を包囲され、戦況は不利な状態のまま。そんな状況で、敵のアシュレイ・アシュラが新たな仲間に加わる。アキトは最後の戦いを前に、切った髪をレイラ・マルカルに渡す。

코드 기아스 망국의 아키토 최종장 사랑스런 사람들에게

Флот Ковчега был разрушен, и значительное количество войск противника было уничтожено вследствие его аварийной посадки.

«W-0» вместе со своим новым союзником Эшли Ашурой готовятся перехватить остальные перегруппировавшиеся силы Рыцарей Святого Михаила и начать финальное наступление на замок Вайссвольф.

Тем временем гиас Шина выходит из-под контроля, и британец решает стереть своего младшего брата с лица Земли раз и навсегда. Но Акито отказывается принять такую участь и, пообещав Лейле вернуться живым, вступает в финальную схватку с Шином.

Quinto y último episodio de Code Geass: Boukoku no Akito. Aunque originalmente se planeó como una serie de cuatro capítulos, el productor Yoshitaka Kawaguchi anunció en el evento del día de estreno en Tokio que el quinto capítulo no programado titulado "Itoshiki Monotachi e" (To Beloved) ya estaba en proceso como la entrega final de la serie para un lanzamiento de otoño de 2015.