本作讲述了池田屋事件后铁之助在新撰组的生活以及在平静生活假象之下暗暗涌动的时代浪潮。日本将迎来一次惊天动地的变革，时代将掀起巨大的浪潮，所有人包括故事的主角们将无一例外地被时代的洪流所淹没……幕末，新撰组即将颠覆，明治维新的曙光开始闪现，是去是留，是生是死，每个人都到了选择的时刻。

The War continues! The ending for the samurai is near.

La guerre continue ! La fin des samouraïs est proche.

慶応四年――幕府軍と薩摩軍の争い“鳥羽伏見の戦い”が始まった。土方は前線で指揮を執り、山崎は隊医として負傷者の救護にあたる。しかし圧倒的に不利な銃撃戦、淀城の薩摩への寝返りと、苦戦する新撰組は次第に追い詰められていく。 一方で、思いを寄せる少女・沙夜を身請けするため奔走していた鉄之助は、隊を離れたまま幕府軍大敗の知らせを聞く。自分は何のために新撰組に入ったのか――屯所へ来て間もない頃、山崎と交わした会話を思い出した鉄之助は、もう一度刀を手に、隊へと戻る決意をするが……抗うことの出来ない運命の戦いが幕を開ける。

게이오 4년, 막부 군과 사쓰마군 사이에서 도바 후시미 전투가 시작된다. 신선조는 히지카타가 전선에서 지휘를 맡는 등 분전하지만, 압도적으로 불리한 총격전이나 요도시로의 사쓰마에의 잠복등으로 고전해, 점차 몰아붙여 간다.그리고, 사모하는 소녀·사야를 납치하기 위해 분주하던 테츠노스케는, 대를 떠난 채 막부군 대패 소식을 듣고, 부대로 돌아갈 것을 결의하지만......