השנה היא 1532. בברצלונה גר אסטבן בן ה-12, ילד יתום שגודל על ידי האב רודריגז, דיקן הקתדרלה. אף אחד לא באמת יודע מאיפה הגיע אסטבן, אבל יש לו כוח מוזר ונפלא.

האספרנסה יוצאת להפלגה הארוכה שלה לעולם החדש על רקע חגיגות רבות. אסטבאן וזיאה מתיידדים ומגלים שהם עונדים מדליונים זהים.

ככל שהאספרנסה מתקרבת למיצרי מגלן, מנדוזה רגוע ובטוח בעצמו. הוא מבלה ארבעה ימים וארבעה לילות ליד ההגה ללא שינה ומנחה את הספינה בהצלחה ללא אירוע.

האספרנסה נתונה באחיזת טורנדו. כשהצוות קושר את עצמו וקפטן פרז עצמו נוטל את ההגה, מנדוזה יורד מתחת לסיפון כדי לחלץ את אסטבאן וזיאה, שעדיין אסירים בכלוב במעצר.

לאחר מסע מסוכן, אסטבאן וחבריו נשטפים אל חופו של אי מסתורי. באותו לילה, מתגנבת לעברם צללית. בשקט, הדמות גונבת תרשים ואקדח, וחוטפת את זיאה. אסטבאן רודף אחר הדמות.

טאו, כעת מאוד מסביר פנים לחבריו החדשים, מראה להם את בית העץ הענק שלו. הוא אומר להם שהוא צאצא של אנשי חווה, גזע של ציוויליזציה עליונה שהאימפריה שלו נהרסה באסון נורא.

כשהסולאריס מפליגה הרחק מהגלפגוס, טאו נפרד מהאי שלעולם לא יראה שוב. כולם בודקים את הספינה מקצה לקצה, בעוד טאו בוחן בקפידה ספר שהוא מקווה שיגלה כיצד להפעיל את הספינה.

לאחר הרפתקאות רבות, אסטבאן וחבריו סוף סוף בדרך אל היבשת החדשה. אבל שם, הם פוגשים את חייליו של המושל פיזארו, אנשים שחושבים רק על זהב.

אסטבן וחבריו בורחים מפיזארו, אבל הספינה המופלאה שלהם, הסולאריס, נלקחת על ידי גאספרד וגומז. הם מציעים להחליף את הספינה בזיאה, ובסוד שלה.

אסטבאן וחבריו בדרכם לכפר של זיאה, כשהם מוקפים בחיילים ספרדים. הילדים מצליחים לברוח, ומוצאים מחסה במקדש תת קרקעי, שם הם פוגשים את הכומר הזקן, פאשה.

גומז לוכד את הילדים ומאלץ את זיאה לחשוף את סוד קיפו הזהב - מסר של האינקה שמגלה ששערי הזהב נמצאות מעבר לפסגת ההר הגבוה. בלילה, אסטבאן והילדים בורחים.

הצבא הספרדי עוקב אחרי אסטבאן וחבריו למבצר הנשר השחור. בחסות החשיכה, הספרדים תוקפים את המבצר, אך טאו גורם להתלקחות רקטה הדוחה את התוקפים ומצילה את המבצר.

כאשר אסטבאן מגיע למקום שנקרא הפסגה הגבוהה, הוא פוגש אדם זקן, מאיוקה, שנראה שהוא יודע משהו על הוריו.

מנדוזה גונב את התותח של הצבא הספרדי על מנת לזכות באמונם של האינדיאנים, אך תוכניתו נכשלת. כששלושת הספרדים עומדים להיות מוצאים להורג, אסטבאן מגיע להציל אותם.

גומז וחייליו תוקפים את מבצר הנשר השחור כדי לנסות לכבוש מחדש את התותח שמנדוזה גנב. מנדוזה משתמש בתותח כדי להשיב מלחמה, אך אינו יכול לעצור את הצבא הספרדי.

בחיפוש אחר ערי הזהב, אסטבאן וחבריו חוצים רמה גבוהה בהרי האנדים. ליד אגם טיטיקקה, הם מותקפים על ידי האורובוס, שבט של ענקים.

אור השמש השוקע מוביל את אסטבאן וחבריו אל הפסל של אלת האדמה, פאצ'מאמה. האגדה מספרת שכאשר פאצ'מאמה תיקח את השמש בזרועותיה, השערים לערי הזהב ייפתחו.

בתוך עיר הזהב הראשונה, אסטבאן מוצא קונדור מוזהב אדיר. כאשר הר הגעש שעליו בנויות הערים מתחיל להתפרץ, הערים נהרסות ועליהם למצוא מחסה בתוך גוף הקונדור.

קונדור הזהב האדיר נושא את אסטבאן וחבריו הרחק מפאצ'מאמה ומהר הגעש המתפרץ, ונוחת במדבר בנאצקה. אבל כשפיזארו וחייליו מגיעים, אסטבאן דואג שכולם יברחו.

הקונדור הזהוב נושא את אסטבאן וחבריו לפסגה הגבוהה, שם הם נתקלים בכוחות הספרדים. בעזרת קונדור הזהב הם עוצרים את גומז וגספרד וממשיכים בחיפוש אחר ארץ בני המאיה.

הקבוצה יוצאת לארץ בני המאיה, על סיפון הקונדור הזהוב, כאשר הם נאלצים לנחות בג'ונגל. הם נתפסים על ידי אמזונות ונלקחים למקדש שלהם, כדי להקריב אותם לאל הגשם.

בג'ונגל, אסטבאן וחבריו מגלים כמה חורבות, מקדשים נטושים ופירמידות. באחד המקדשים, פדרו וסנצ'ו מנסים להסיר מסיכת ירקן מהקיר כשהמסכה מתחילה לזהור.

לאחר שפתרו את סוד מסכת הירקן הירוקה, אסטבאן וחבריו מוצאים כתב יד שנדמה כי הוא מכיל את המפתח למקום הימצאן של ערי הזהב. אבל כמעט מיד, הם נתפסים.

אסטבאן וחבריו נתפסים על ידי אינדיאנים שרוצים להקריב אותם כדי לטהר את האגם הקדוש שלהם מזהב. מרנצ'ה ודוקטור לגוארה מנסים להרעיל את האגם כדי שיוכלו להשיג את כל האוצר בקרקעית.

נאמר כי אל הנחש של בני המאיה חצה את ההרים כדי לבנות עיר חדשה במזרח, בין הביצות של אל הגשם. אסטבאן וחבריו יוצאים למצוא את העיר השנייה הזו.

אסטבאן וחבריו מוצאים את עיר הזהב השנייה, אך הם נלכדים על ידי מארינשה והדוקטור. הדוקטור מוצא כתב יד חדש, אך נלכד במלכודת שהונחה ברצפת המקדש.

אחרי הרבה נסיעות והרפתקאות רבות, אסטבאן וחבריו מגלים סוף סוף את המקדש השלישי שנבנה עמוק בתוך מערה ענקית. פסל זהב מחזיק בכתב יד שלישי המזכיר הר המכונה "המגן הבוער".

לאחר שמצאו את המגן הבוער, אסטבאן וחבריו נופלים לידיהם של האולמקים המסתוריים, בעלי טכנולוגיה מתקדמת מאוד. הם בורחים מהם, אך שוב נתפסים.

באמצעות הטכנולוגיה המתקדמת שלהם, האולמקים מסוגלים לאסוף אנרגיה מחום השמש, ומעומק כדור הארץ. הם לוכדים את אסטבאן, טאו וזיאה, מתוך כוונה להיות צעירים שוב.

אסטבאן וחבריו אורחים בכפר השמש החדש. אבל האולמקים מצאו את קונדור הזהב, ומתכוננים לתקוף את הכפר, בעזרת הדוקטור ומרינצ'ה, שמתכוונים לגנוב לעצמם את ציפור הזהב הגדולה.

בעזרת גומז וגספרד, אסטבאן וחבריו מצליחים לגרום לקונדור הזהב לעוף. אבל האולמקים מוצאים את הכפר האינדיאני של השמש החדשה, ומבצעים מתקפה עזה.

בכפר האינדיאני של השמש החדשה, זיאה סוף סוף מוצאת את אביה, פאפאקאמיו. אבל האושר שלה קצר מועד לאחר המתקפה של האולמקים.

בני המאיה מתחמשים ותוקפים את האולמקים, שרודים בהם כבר שנים. מהקונדור הזהוב, אסטבאן ושאר הילדים מפציצים את האולמקים באבנים, ומסיטים את גאות הקרב לטובת בני המאיה.

אסטבאן וחבריו מצליחים למצוא את דרכם לבסיס אולמק. אבל קלמק מגלה אותם ולוקח את זיאה בשבי. לפתע, מכונת מלחמה ענקית מזנקת ממעמקי המקדש התת-קרקעי של אולמק.

אסטבאן מטיס את הקונדור הזהב נגד מכונת המלחמה הנוראה של אולמק, כדי לנסות להציל את זיאה. טאו ואסטבאן מצליחים להזניק את המכונה לאוויר וזיאה ניצלת. אלא שטאו נשאר מאחור, כאסיר.

עם טאו כבן ערובה, האולמקים מאלצים את אסטבאן וזיאה להשתמש במדליונים שלהם כדי לפתוח את הדלתות לעיר הזהב.

לאחר שפצע את הכהן הגדול של ערי הזהב, קלמק גונב את האוצר הגדול, מקור מרוכז לכוח השמש הנקרא גם יחידת כוח השמש. עם זאת, מערכות האבטחה של העיר מופעלות.

האולמקים מניחים את יחידת כוח השמש בתחתית הגביש האוסף את אור השמש שלהם ומפעילים אותו. עם זאת, היחידה לא מתנהגת כמצופה ויחידת כוח השמש מתחילה להתחמם יתר על המידה.