Wir schreiben das Jahr 2012. Die Bevölkerung der Welt beträgt knappe 6 Millionen Menschen. Amerika, Europa, Asien, Afrika, Australien - alle wurden sie ausradiert. Nur Tokio und einige kleinere Teile Japans existieren noch.

Als Tokio überraschend angegriffen wird, ist Kamina Ayato plötzlich auf sich alleine gestellt. Geführt von der mysteriösen Mishima Reika stößt er tief unter Tokio auf einen geheimen Tempel und den Ursprung RahXephons, aber was hat es mit diesem riesigen Mecha auf sich? Was hat gerade Ayato mit ihm zu tun und welche Geheimnisse verbirgt Reika noch?

Ayato Kamina, 17 ans, est lycéen à Tokyo où travaille sa mère. Sa vie, en apparence banale, va basculer le jour où il fera la connaissance de la mystérieuse Reika Mishima. Cette dernière le guidera jusqu'à Xephon, un mecha gigantesque, auquel Ayato a toujours été lié sans le savoir. Peu après, l'adolescent découvrira que le sang de sa mère est bleu et que le monde dans lequel il vivait, baptisé Tokyo Jupiter, n'était qu'une enclave isolée du reste du monde et contrôlée par les Mulien, des ennemis de l'Humanité. Choqué, Ayato va alors se replier sur lui-même avant de chercher à trouver sa place dans ce monde, coincé entre des militaires humains qui veulent l'utiliser et des Muliens qui le convoitent.

21世紀初頭の東京。母子で暮らす高校生・神名綾人は、模試会場に向かう途中に突如上空に現れた謎の航空部隊の攻撃に遭遇した。破壊された街で、綾人は自分の描いた絵に酷似した風景の中で、不思議な少女・美嶋玲香に出逢う。玲香に導かれるようにして地下鉄に乗り、神殿にたどりついた綾人は、卵から巨大な人型の存在｢ラーゼフォン｣が出現する瞬間にめぐりあわせた。｢真実を見せる｣その言葉に従って、謎の女性・紫東遙とVTOLで東京を脱出しようと試みた綾人は、玲香に導かれてラーゼフォンに同調、体内へと入っていく。ついに目覚めのときがきた。超兵器ドーレムを粉砕したラーゼフォンは、そのまま東京から飛び去っていった。外から故郷を見た綾人は、そこに巨大な木星のような｢TOKYO JUPITER｣を目撃する。謎の存在MUに占拠された首都は、不思議な膜に閉鎖され、住民は偽りの生活をさせられていた。しかも外部には、12年も先の時間が流れていたのだった…。東京を支配する｢青い血｣の人間とは何者か？綾人とラーゼフォンには、どんな関係があるのか？そして真実の世界で、綾人を待ち受ける運命は何か？

21세기 초, MU라는 정체불명의 존재들에게 습격당하여 일본의 수도 도쿄는, MU에 의해 고립되었다. MU에게 점거당한 도쿄에는 목성과 흡사하게 생긴 배리어가 쳐져 함부로 나갈 수도, 들어갈 수도 없게 되었고 이렇게 변해버린 도쿄에서는 바깥보다 시간이 6배 느리게 흘러가며 이른바 이 도쿄 쥬피터 안에서 살고 있는 이들은 어떤 계기로 인해 도쿄 외의 세계가 모두 멸망해버렸다는 거짓된 기억을 주입받은 채 살아가게 된다. 도쿄 쥬피터 안에서 평화롭게 살아가고 있던 카미나 아야토는 어느날 전차 사고를 당해 도움을 줄 사람을 찾기 위해 거리로 나왔다가 전쟁이 벌어지고 있다는 사실을 깨닫게 되고, 거리에서 몇 년 전의 그 사건 이후로 본 적이 없었던 동급생 미시마 레이카의 모습을 발견하고 쫓아가다가 갑자기 자신을 찾아와 진실을 보여주겠다고 말하는 시토 하루카에게 이끌려 도쿄 쥬피터를 벗어나게 된다. 하지만 도쿄를 탈출하려던 찰나 무언가가 자신을 부르고 있다며 홀연히 전투기에서 탈출한 아야토는 연주자로써 각성, 신전에 있던 거대병기 라제폰에 탑승하게 되고 정체불명의 병기와의 전투 끝에 하루카, 라제폰과 함께 장벽 밖으로 나가게 된다. 장벽 밖으로 나온 아야토는 도쿄 쥬피터에 대한 모든 사실을 알게 되고 하루카가 소속된 대 MU 전략 연구 기관인 테라에 들어가 속속들이 출현하는 MU의 병기인 돌렘들과 싸워나가게 된다.

RahXephon é uma série anime de ficção científica sobre o jovem Ayato Kamina, e sua habilidade para controlar um robô poderoso conhecido como RahXephon.

A história começa no princípio do século XXI no Japão, onde, Tóquio aparentemente pacífico é repentinamente atacada.

Ano 2012, o mundo foi destruído, a exceção de Tokyo, ao menos foi isso que Kamina Ayato aprendeu na escola. Quando Tokyo é atacada, Ayato consegue escapar e meio a batalha com uma "arma" muito especial o RahXephon. O que ele descobre no mundo além da sua cidade é que tudo o que ele pensava ser verdade, não passava de uma ilusão. Não apenas o resto do mundo sobreviveu, como também estão em guerra contra Tokyo. Agora, Ayato luta para decifrar os mistérios da sua origem, e da própria existência do Rahxephon.

Идёт 2015 год. Семнадцатилетний Камина Аято заканчивает школу в Токио. Из родителей у него — только вечно занятая мать. Два года назад в результате нападения неизвестных захватчиков всё человечество погибло, осталась невредимой только относительно небольшая территория с центром в Токио, выехать за пределы которой невозможно. Ученикам говорят в школе, что всё население планеты составляет теперь не более 23 миллионов человек.

Однажды утром по дороге в школу Аято становится свидетелем начала войны — силы самообороны отражают нападение неизвестного врага, применяя, помимо обычной боевой техники, невиданное оружие, имеющее вид гигантских существ или роботов гуманоидного типа — долемов.

21世纪初，日本的首都东京被外部入侵者Mu（读作"moo"）用半圆形的障壁与外界隔绝，身处障壁外部的人称该障壁为"Tokyo Jupiter"（因障壁的外观酷似木星），身处内部的人则相信“东京以外的世界已经灭亡”。数年之后，居住在东京的主角神名绫人在赶往模拟考试的试场途中，遇上了电车意外。绫人在寻找救援的途中，遇到了一名神秘少女“美嶋玲香”，并在她的引导之下，到了一座地下神殿。此时，东京上空突然出现了会“唱歌”的神秘“物体”，并与绫人产生了“共鸣”，使他在神殿倒下了。在混乱的意识之中，绫人说了一声“RahXephon”。然后，神殿内的“巨人”觉醒了……

21世紀初，日本的首都東京被外部入侵者「姆」（Mu）用半圓形的障壁與外界隔絕，身處障壁外部的人稱該障壁為「東京木星」（Tokyo Jupiter，因障壁的外觀酷似木星），身處內部的人則相信「東京以外的世界已經滅亡」。數年之後，居住在東京的主角神名綾人在趕往模擬考試的試場途中，遇上了電車意外。綾人在尋找救援的途中，遇到了一名神秘少女「美嶋玲香」，並在她的引導之下，到了一座地下神殿。此時，東京上空突然出現了會「唱歌」的神秘「物體」，並與綾人產生了「共鳴」，使他在神殿倒下了。在混亂的意識之中，綾人說了一聲「RahXephon」。然後，神殿內的「巨人」覺醒了……

21世紀初，日本的首都東京被外部入侵者「姆」（Mu）用半圓形的障壁與外界隔絕，身處障壁外部的人稱該障壁為「東京木星」（Tokyo Jupiter，因障壁的外觀酷似木星），身處內部的人則相信「東京以外的世界已經滅亡」。數年之後，居住在東京的主角神名綾人在趕往模擬考試的試場途中，遇上了電車意外。綾人在尋找救援的途中，遇到了一名神秘少女「美嶋玲香」，並在她的引導之下，到了一座地下神殿。此時，東京上空突然出現了會「唱歌」的神秘「物體」，並與綾人產生了「共鳴」，使他在神殿倒下了。在混亂的意識之中，綾人說了一聲「RahXephon」。然後，神殿內的「巨人」覺醒了……

In a world where time passes at a crawl and the blood of your neighbor runs blue, 17 year old high school student Ayato Kamina goes about his daily life within Tokyo Jupiter oblivious to the world around him, having been educated with the fact that the all civilization but Tokyo has been destroyed. But all that changes when the mysterious civilization "MU" invades his home, raining destruction down from the sky in the form of strange monsters called Dolems. The events that occur next will lead Ayato to the mysterious woman named Reika Mishima, to the truth of their existence, the discovery of what and who he is, and to the powerful angelic robot RahXephon.

Ayato Kamina es un joven de 17 años que vive en un Japón completamente aislado del mundo exterior. A pesar de que en Tokio la vida transcurre en aparente normalidad, más allá de sus muros lo que queda de la raza humana lleva quince años librando una batalla desesperada contra las fuerzas invasoras que han devastado en el resto del mundo. Cuando esa guerra se traslada al interior de la ciudad de Tokio, Ayato descubrirá horrorizado que ya no se puede hacer nada. Despertará en un mundo nuevo donde la única oportunidad de supervivencia de la humanidad pasa por descubrir todos los secretos de un gigantesco robot que aparentemente sólo él puede controlar, el arma definitiva conocida como RahXephon.

Ayato Kamina es un joven de 17 años que vive en un Japón completamente aislado del mundo exterior. A pesar de que en Tokio la vida transcurre en aparente normalidad, más allá de sus muros lo que queda de la raza humana lleva quince años librando una batalla desesperada contra las fuerzas invasoras que han devastado en el resto del mundo. Cuando esa guerra se traslada al interior de la ciudad de Tokio, Ayato descubrirá horrorizado que ya no se puede hacer nada.

Ayato Kamina è un adolescente che vive nel 2012 dentro la città di Tokyo Jupiter, città chiusa in una grossa sfera energetica rallentata nello scorrere del tempo rispetto al resto del mondo che fanno in modo che gli abitanti vivano in un tempo e in una dimensione a parte. Grazie all'incontro con il maggiore Haruka Shitow del gruppo militare Terra, Ayato, uscendo dalla città chiusa, scoprirà tante verità delle quali era sempre stato tenuto all'oscuro, così come tutti gli altri abitanti di Tokyo Jupiter. Verrà a conoscenza degli invasori multi-dimensionali MU, ma soprattutto sarà in grado di (e sarà pure costretto dai militari) pilotare nelle battaglie l'enigmatico e misterioso robot Rahxephon e combattere contro le incursioni dei nemici chiamati Dolem.