A year after the Fairy Tail guild has overcome the diabolical forces of Acnologia and Zeref, Natsu and his team trek into the northern continent of Guiltina, where they seek out the employer of the 100 Years Quest and receive their nearly impossible mission: to seal away the Five Dragon Gods—a group of individuals with such vast power that, if left alone, could cause global devastation. Meanwhile, a spirited new member named Touka is recruited to Fairy Tail. Although her vibrant energy and passionate nature makes her perfect for the guild, there seems to be more to her than meets the eye.

Um ano depois que a guilda Fairy Tail superou as forças diabólicas de Acnologia e Zeref, Natsu e sua equipe viajam para o continente norte de Guiltina, onde procuram o empregador da Quest dos 100 Anos e recebem sua missão quase impossível: selar os Cinco Deuses Dragões - um grupo de indivíduos com um poder tão grande que, se deixados sozinhos, poderiam causar uma devastação global. Enquanto isso, um novo membro espirituoso chamado Touka é recrutado para a Fairy Tail. Embora sua energia vibrante e natureza apaixonada a tornem perfeita para a guilda, parece haver mais nela do que aparenta.

フィオーレ王国随一で、お騒がせ魔導士ギルドとしても有名な「妖精の尻尾フェアリーテイル」。そこに所属するナツ・ルーシィ・ハッピー・グレイ・エルザ・ウェンディ・シャルルの最強パーティーは、旅立ちの時を迎えようとしていた。目指す先は遥か北の大地・ギルティナにあるという世界最古の魔導士ギルド「魔陣の竜マギア・ドラゴン」。黒魔導士ゼレフや黒竜アクノロギアとの死闘を乗り越えたナツたちに、＜Ｓ級クエスト＞の更に上級である＜100年クエスト＞に挑む許可が特別に下りたのだ。＜100年クエスト＞は、「魔陣の竜」が創設されてから百余年、誰一人として達成できていない伝説級の難関依頼。初めての大陸の“不可思議な街”、初めて出会う“不可解な神”、そして動き出す“不気味な敵”…。