Sousuke und Kazama untersuchen, wer peinliche und aufschlussreiche Bilder von Kaname im Internet veröffentlicht hat. In der Zwischenzeit extrahieren Amalgam-Aktivisten unter der Führung von Gates Zahlungen von der balischen Streitmacht, die Mithril übernommen hat und versuchen zu rekonstruieren, was in der Schlacht passiert ist.

In Nanjing entführt die Amalgam Friedensdelegationen aus Nord- und Südchina und befestigt sich in einem Tunnel unter dem Jangtse. Mithril versucht eine Rettung in den gefährlichen Räumen des Tunnels, gerät jedoch in Amalgams Falle.

Mithril ist ratlos darüber, wie der Feind seinen Bewegungen folgen kann. Sobald sie feststellen, dass ihre Kommunikation beeinträchtigt wurde, geben Tessa und Commander Andrei Kalinin falsche Befehle, um die Rettung zu erleichtern und Amalgam den Spieß umzudrehen.

Die SRT reist nach Sizilien, um den Verräter aus der Operation in Nanjing zu fangen. Ein mysteriöser AS scheint dem Team zu helfen wegzukommen. Angesichts des Alltagsstresses beschließt Mao, Sousuke nach seinen eigenen Zukunftsplänen zu fragen.

Mithril versucht mehr über die mysteriöse Amalgam-Organisation zu erfahren. Die Beziehung zwischen Sousuke und Kaname beginnt zu blühen. Die Mithril-Führung verbietet ihm jedoch sie zu sehen, nachdem seine Leibwächterpflichten einem anderen Agenten übertragen wurden.

Sousuke diskutiert mit seinem Nachfolger Agent Wraith, über die Mission, Kaname zu schützen. Kaname wundert sich, warum Sousuke seit Tagen nicht mehr am Unterricht teilgenommen hat und beginnt sich Sorgen zu machen. Als sie ihn nach einer zufälligen Begegnung mit Amalgam-Agent Xia Yu Lan sehen muss, findet sie seine Wohnung leer vor. Sousuke ist verschwunden.

Nachdem Sousuke wieder auf Merida Island angekommen ist, beschimpft ihn Tessa, weil er sich mit Kaname beschäftigt und seine anderen Pflichten vernachlässigt. Belfangan Clouseau, der Pilot der AS, wechselt als neuer Kommandeur zur SRT.

Kaname konfrontiert Agent Wraith mit Sousukes Abreise, doch als sie Antworten erhalten will, überfällt Xia Yu Lan die beiden. Kaname überlistet ihren Verfolger, bis Leonard Testarossa, ein weiterer Amalgam-Agent, der auch Tessas Bruder ist, auftaucht und Xia Yu Lan tötet. Er enthüllt, dass der Attentäter Agent war, der außerhalb von Amalgams Interessen handelte.

Die Zwillingsschwester von Xia Yu Lan, Yu Fan, entführt einen Venom AS, um ein Provokateur zwischen den Einheiten der nord- und südchinesischen Armee in Hongkong zu werden. Sousuke und Melissa werden von Gavin Hunter in einem Team von SRT /​ PRT-Mitarbeitern ostasiatischer Herkunft in die Region entsandt, um die AS zu finden.

Sousuke wandert weiter in Hongkong und trifft auf eine Prostituierte, die Kaname sehr ähnlich sieht. Tessa wird von Admiral Jerome Borda „gezwungen“, Clouseau, Melissa und Kurz auf die Insel zu entsenden, nachdem die Sichtungen der Venom AS bestätigt wurden.

Xia Yu Fan führt Sousuke nach Gauron, während sie in Hongkong gegen Clouseau, Melissa und Kurz antritt. Kurz vor dem Tod, erklärt Gauron die Wahrheit über Amalgam und verspottet Sousuke, indem er behauptet, Kaname getötet zu haben. Wütend tötet Sousuke Gauron und verlässt das Gebäude, als eine Bombe unter seinem Bett explodiert.

Sousuke ist immer noch betroffen von Gaurons Behauptungen, Kaname getötet zu haben. Inspiriert von ihrer Anwesenheit steuert Sousuke die Arbalest erneut, um Gates und seine Männer zu zerstören. Kaname kehrt nach Japan zurück. Sousuke steht vor dem Mithril-Kommando, das seiner Bitte nachkommt, bei Kaname zu bleiben, trotz seiner Lohnsenkung.