本作的故事发生在“武侦”（行使武力的侦探）育成学校东京武侦高校。主人公远山金次所属的专业是侦探科，等级为E，但其实他之前曾是强袭科所属，而且入学时的等级是S。金次平时是个极其平凡的男生，但其实一性亢奋就会进入能力是平时30倍的亢奋状态。初中时他曾经由于此能力而被部分女生摆布，后来为了不让事件再次发生而向周围隐瞒起来。本来过着平稳高中生活的他，有一天突然被卷入爆炸事件，并因此遇见了强袭科的精英神崎·H·亚里亚，从此他的生活就发生了大转变.....

為對抗殘暴罪犯，存在著警察無法應對的治安危機的世界之中，出現了一種彌補警察不足的武裝偵探，在法律限制內解決個人或組織的委託，通稱「武偵」。2009年，東京武偵高中是專門培育武偵的特殊學校，學生的義務是必須攜帶槍械與刀劍，在這所學校偵探科二年級的男主角遠山金次，被自己所擁有的某種特殊體質（一種會在某種契機之下使大腦細胞高度活性化，並且附帶某種奇怪的副作用）所深深困擾著，對於這一點他始終希望對其他人保密，只祈求能過平凡的校園生活…

可惜事與願違，二年級的遠山金次在某天上學途中被捲入一起「武偵殺手」的炸彈魔攻擊，在身處絕境時，一位美少女從天而降，從此金次與強襲科的超精英─S級武偵神崎·H·亞莉亞相遇（外表可愛、身材嬌小卻非常有能力，同時也是個狂暴並富有攻擊性的女孩），就這樣，被迫與最強武偵亞莉亞組隊的金次，開始了面對兇惡罪犯的日常生活，而他冀望的平凡生活也逐漸遠去…

Vysoká škola Tokio Butei je zvláštní institut, kde jsou cvičeni elitní detektivové. Druhák Tohyama Kinji má navíc zvláštní schopnosti, které se ale snaží utajit, aby mohl žít jako obyčejný student. Naneštěstí se mu to moc nedaří, protože se stane obětí bombového útoku, díky kterému se seznámí s nejlepší studentkou Arií H. Kanzaki.

Tokyo Butei High School is een speciale school waar gewapende rechercheurs, de Butei, worden getraind in het gebruik van wapens. Kinji Touyama is een tweedejaars student en heeft de bijzondere eigenschap dat hij, wanneer hij opgewonden raakt door het andere geslacht, bijna bovenmenselijke kracht ontwikkelt. Hij houdt dit echter geheim, zodat hij een gewoon, vredig leven kan blijven leiden. Op een dag wordt hij echter op weg naar school betrokken bij een bomaanslag en ontmoet vervolgens Aria H. Kanzaki, waardoor er abrupt een einde komt aan zijn vredige schooltijd.

In response to the worsening crime rate, Japan creates Tokyo Butei High, an elite academy where "Butei" or armed detectives hone their deadly skills in hopes of becoming mercenary-like agents of justice. One particular Butei is Kinji Tooyama, an anti-social and curt sophomore dropout who was once a student of the combat-centric Assault Division. Kinji now lives a life of leisure studying logistics in order to cover up his powerful but embarrassing special ability. However, his peaceful days soon come to an end when he becomes the target of the infamous "Butei Killer," and runs into an emotional hurricane and outspoken prodigy of the highest rank, Aria Holmes Kanzaki, who saves Kinji's life and demands that he become her partner after seeing what he is truly capable of.

Les Butei sont connus comme étant des détectives armés entraînés dans une école spéciale, portant le même nom qu'eux. 

Tohyama Kinji est un étudiant de ce lycée, que l'on pourrait qualifier de banal à première vue. Mais il ne faut surtout pas se fier aux apparences, car celui-ci veut tout simplement faire en sorte de vivre le plus calmement et le plus normalement possible. En réalité, il veut cacher aux autres élèves que son corps possède un pouvoir assez particulier; ce corps peut passer en super-mode lorsqu'il s'avère stimulé par une certaine chose. 

Cependant, lors d'un soudain attentat à la bombe, il fait la rencontre d'Aria H. Kanzaki, une lycéenne de la section d'élite de Butei. Et à partir de ce moment, sa vie ne sera peut-être pas aussi tranquille qu'il ne l'aurait espéré…

Die Tokyo Butei High School ist eine Spezialschule, an der bewaffnete Detektive, die Butei, im Waffengebrauch ausgebildet werden. Kinji Touyama ist Schüler des zweiten Jahrgangs und verfügt über die spezielle Fähigkeit, dass er, sobald er durch das andere Geschlecht erregt wird, geradezu übermenschliche Kräfte entwickelt. Das hält er jedoch geheim, damit er weiterhin ein gewöhnliches, friedliches Leben führen kann. Eines Tages gerät er jedoch auf dem Weg zur Schule in einen Bombenanschlag und trifft in der Folge auf Aria H. Kanzaki, womit seine friedliche Schulzeit ein jähes Ende findet.

Protagonista di Hidan no Aria è Kinji Toyama, normalissimo studente di un liceo di Tokyo decisamente fuori dal comune, la Butei High School. Nota anche come Academy Island, questa scuola è stata creata al solo scopo di addestrare i suoi studenti all'uso delle armi, in modo che, al termine degli studi, questi possano fregiarsi dell'ambito titolo di 'Butei'. Creati allo scopo di fronteggiare la criminalità organizzata, i Butei sono dei detective armati fino ai denti e disposti ad accettare, dietro compenso, qualsiasi incarico ricada nei limiti imposti dalle 'Butei Laws'. Kinji, però, a dispetto delle sue capacità, non è in alcun modo intenzionato a diventare un Butei, e per tale ragione, allo scopo di preservare la sua tranquilla vita da normale adolescente, ha deciso di celare a tutti la sua potente abilità speciale, chiamata 'Histeria Mode'. Il suo desiderio, tuttavia, sembra essere destinato a rimanere una pura utopia: gli eventi, infatti, inizieranno a prendere una brutta piega quando, andando a scuola, Kinji scoprirà di essere rimasto vittima di un attentato, da cui riuscirà a scampare miracolosamente solo grazie al rocambolesco intervento della bella e pericolosa Aria H. Kanzaki, la più forte studentessa di livello S della Butei High School.

凶悪化する犯罪に対抗するため、武力で問題の解決にあたる探偵、通称「武偵」。遠山キンジは、武偵の育成施設である武偵高校の生徒だったが、とある事件が元で、武偵高をやめて一般の学校に移るつもりでいた。そんなある日、なぜかキンジは登校中に爆弾魔に命をねらわれてしまう。だが追い詰められたキンジの前に、突然空から美少女が舞い降りてきた。彼女の名は神崎・Ｈ・アリア。小柄で可憐な外見からは想像のつかないような優秀な凄腕武偵だった。この出会いが、キンジとアリア、２人の今後を大きく変えていく。

낙제생 최약 무력탐정 아카리가 동경하는 최강 무력탐정 아리아 선배와 전자매계약을 맺기 위해 노력하는 이야기를 그린 애니메이션

Akcja ma miejsce w Liceum Tokio Butei, gdzie tak zwani "uzbrojeni detektywi" – "Butei" – szkoleni są w korzystaniu z broni. Kinji Tooyama to uczeń drugiego roku, który posiada pewną specjalną zdolność, ale trzyma ją w sekrecie przed innymi, aby móc nadal wieść zwyczajne, spokojne życie. Kiedy pewnego dnia w drodze do szkoły pakuje się w kłopoty, a dokładniej w samo centrum ataku bombowego, spotyka Arię Kanzaki – najpotężniejszą Butei Klasy-S w szkole!

A série é criada pelo JCStaff estúdio, baseado no manga de Chuugaku Akamatsu também conhecido como "Aria the Scarlet Ammo". A história se passa em Tóquio Butei High School, uma escola especial, onde futuros detetives - "Buteis" - são treinados para usar armas. Kinji Touyama é um estudante do segundo ano, que tem uma habilidade especial, mas ele mantém um segredo para manter uma vida pacífica. No entanto, quando ele fica preso em um bombardeio no caminho para a escola, ele encontra H. Aria Kanzaki, membro do departamento de elite, a mais poderosa S-Rank estudante da Butei. Com este fato ocorre varias mudanças no trajeto de vida de Kinji

Японские преступники обнаглели настолько, что для борьбы с ними помимо полиции потребовались вооруженные частные детективы — «бутэй». Охотников за головами готовят в спецшколах, где многие не выдерживают суровой учебы, а некоторые не доживают до выпуска.

En respuesta a la tasa de criminalidad empeoramiento, Japón crea Tokio Butei, una academia de élite donde "Butei" o detectives armados perfeccionar sus habilidades mortales con la esperanza de convertirse en agentes mercenarios como de la justicia. Un Butei particular es Kinji Tooyama, un estudiante de segundo año de abandono antisocial y cortante que una vez fue un estudiante de la División de Asalto de combate-céntrica. Kinji ahora vive una vida de ocio que estudian la logística con el fin de encubrir su alcance pero embarazosa habilidad especial. Sin embargo, sus días de paz pronto llegará a su fin cuando se convierte en el objetivo de la infame "Asesino Butei", y se ejecuta en un huracán emocional y prodigio abierto de más alto rango, Aria Holmes Kanzaki, que salva la vida de Kinji y exige que se convirtiera su pareja después de ver lo que es realmente capaz de hacer.

En respuesta a la tasa de criminalidad empeoramiento, Japón crea Tokio Butei, una academia de élite donde "Butei" o detectives armados perfeccionar sus habilidades mortales con la esperanza de convertirse en agentes mercenarios como de la justicia. Un Butei particular es Kinji Tooyama, un estudiante de segundo año de abandono antisocial y cortante que una vez fue un estudiante de la División de Asalto de combate-céntrica. Kinji ahora vive una vida de ocio que estudian la logística con el fin de encubrir su alcance pero embarazosa habilidad especial. Sin embargo, sus días de paz pronto llegará a su fin cuando se convierte en el objetivo de la infame "Asesino Butei", y se ejecuta en un huracán emocional y prodigio abierto de más alto rango, Aria Holmes Kanzaki, que salva la vida de Kinji y exige que se convirtiera su pareja después de ver lo que es realmente capaz de hacer.