Sammy et Scooby en folie : Un jour, Sammy apprend qu'il hérite de la fortune (estimée à 1 milliard de dollars) ainsi que du manoir de son oncle Albert. Nos deux compères quittent le scooby-gang pour retrouver l'oncle Albert qui a disparu. Ils devront affronter tout au long de la série un savant fou, Phineus Phibes, et son organisation. Ils veulent la dernière invention de l'oncle Albert. Cette invention est basée sur la nanotechnologie qui peut donner temporairement aux animaux et aux humains de pouvoirs surhumains. Cette invention a été transformé en Crocs Scooby pour que les animaux puissent l'utiliser sans danger comme expérimentation. On apprend tout au long de la série que l'oncle Albert a infiltré incognito, en se déguisant, l'organisation du docteur Phineus Phibes et met au courant en secret Sammy et Scooby-Doo des mauvais tours de Phineus Phibes...