L'autobus qui conduit les étudiants à la compétition des Neuf écoles est attaqué par des forces inconnues et Tatsuya pense que le coupable est quelqu'un de l'intérieur.

Tatsuya et ses coéquipiers ont une stratégie pour vaincre Cardinal George et le Prince Crimson à Monolith Code, mais ils ont peut-être sous-estimé leurs rivaux.

Tatsuya reste vigilant car les Dragons sans tête décident de prendre des actions encore plus sévères pour s'assurer que la compétition des Neuf écoles soit annulée.

Les étudiants de la Première école célèbrent les victoires obtenues à la compétition des Neuf écoles, et Tatsuya, furieux contre les Dragons sans tête, leur rend visite.

Suite à la défaite de Lina et des forces des USNA, les Yotsuba s'assurent la non-interférence du colonel Balance.

Toutefois, le problème des parasites persiste et Tatsuya décide de prendre les devants, utilisant Pixie afin de les localiser.

Grâce à Honoka, Pixie démontre des pouvoirs psychiques assez puissants pour neutraliser les parasites.

Mais au moment d'emmener ces derniers, de faux policiers à la solde de la 3e division de contre-espionnage s'emparent d'eux.

Devinant leur objectif, Tatsuya relaie à Mayumi une mise en garde à la famille Saegusa quant au danger qu'ils représentent.

Tatsuya et Lina apprennent que les parasites sont rassemblés en un lieu, et décident de les éliminer. Tatsuya a mis au point une méthode pour sceller les parasites et les neutraliser à défaut de les détruire, mais ses efforts sont entravés par Lina qui est aveuglée par sa mission.