Velma tiene una entrevista en la prestigiosa Universidad de Kingston, la escuela más selectiva del país. Pronto sabrá que el decano quiere que ella y el resto de la pandilla averigüen por qué el fantasma de Elias Kingston, el fundador de la universidad, recorre la biblioteca.

La pandilla va en el fondo de una antigua caverna cuando Fred recibe una llamada aterrada de su amigo Chuck. allí se encontraran el fantasma de un aterrador guerrero gallina.

La pandilla visita al primo de Fred en su crucero, aunque Velma tiene un caso severo de hidrofobia. El crucero es atacado por monstruos marinos que defienden las aguas que están transitando.

La pandilla visita el set de rodaje del programa favorito de Scooby y allí se encuentra con la pequeña perrita que interpreta a un detective en la pequeña pantalla. El programa de televisión necesita la ayuda de la pandilla para que continúe luego de ser atacado por una gárgola fantasmal.

Cuando un guía del museo apuesta que puede conducir mejor al grupo de Fred, cambian lugares para resolver el misterio del dios llamado Sobek.

Cuando la pandilla visitan "El Dosel de Cristal", que está a punto de cerrar a causa de un monstruo que vive en las cuevas, ellos deben impedir que cierre.

Daphne lleva a la pandilla a una fiesta donde tienen que vestir al estilo victoriano y resolver un falso misterio. Pero un jinete sin cabeza real comienza a secuestrar a la gente, entonces el grupo tendrá que resolver este caso sin salir de sus personajes.

La pandilla se hace pasar por una banda para investigar la aparición del fantasma de la Prima Donna la cual ahuyenta a cualquiera que desee actuar en su teatro.

El chef favorito de Shaggy y Scooby por fin abrirá su propio restaurante, pero un Yeti los amenaza durante la noche de inauguración. La pandilla debe resolver el misterio antes de que sirvan el postre, ¡y Shaggy y Scooby deben resistir sus deseos de comer toda la comida que les servirán a los clientes!

Cuando la pandilla va a una empresa de tecnología, una de las invenciones llamada el mayordomo 3000 se vuelve loco y comienza a atacar a los trabajadores. La pandilla debe resolver el misterio antes de que sea demasiado tarde para la compañía y posiblemente para ellos mismos.

La pandilla es atrapada por el área 51 porque ellos creen que el grupo de adolescentes son extraterrestres y son sometidos a interrogatorios mientras un alienígena está atemorizando el lugar.

En un clásico embrollo con una casa embrujada, un millonario al que una vez Scooby le salvó la vida, ¡lo incluye en su testamento! Ahora, para cobrar la parte de la fortuna que le corresponde a Scooby, la pandilla debe pasar una noche en una mansión aterradora, ¡junto con los parientes excéntricos del millonario y un fantasma aterrador!

Es Nochebuena y Fred está dispuesto a resolver un misterio en la Navidad. Por desgracia, la ciudad donde la pandilla se encuentra, está siendo atacada por un pterodáctilo y no parece tener mucho que ver con la Navidad.

Fred visita una prisión de máxima seguridad y termina investigando el caso de un preso fugitivo fantasma llamado Stealin Stan que está causando estragos allí.

La pandilla puede viajar en el primer vuelo de prueba en el avión más grande del mundo, el Air Gigantica. Se enteran de un gremlin que intenta destruir este avión y lo buscan durante el vuelo.

Un hechicero ataca una fábrica de galletas que Scooby y Shaggy aman, por lo que la pandilla interviene para capturarlo.

Mientras la pandilla visita Nueva Orleans (y Daphne finge ser un vampiro), se encuentran con una criatura pantanosa que mantiene a todos fuera de las tierras pantanosas.

La pandilla golpea las pistas de esquí, aunque Daphne está más concentrada en golpear a Fred con una bola de nieve de venganza. Su diversión nevada pronto se ve interrumpida por la aparición de un malvado Monstruo de muñeco de nieve ansioso por asustar a todos los intrusos de su montaña.

La pandilla visita Irlanda en busca de un castillo que la familia de Daphne acaba de descubrir que poseen y descubren que un gigante vendrá a destruirlos a todos.

The gang goes to a farm, where Fred develops a crush on Beth, a farmer's daughter. When a living scarecrow appears, Fred tries to impress Beth with his mystery solving skills, while Velma gets severe hay allergies and Daphne begins hoarding animals as "pets" after becoming jealous of Shaggy and Scooby's relationship.

After the ghost of the Cliff Bride begins haunting a wedding that the gang is attending, they must go to extreme lengths to try to keep the bride, who is very superstitious, from finding out. However, this proves very challenging when the ghost seems to appear everywhere that the bride is. Meanwhile, Daphne becomes very wrapped up in the ideology of wedding traditions and Shaggy worries obsessively about his best man speech.

Fred takes the gang to Mexico so they can experience the local Day of the Dead festivities. A mystery quickly pops up involving a long-dead historical figure named El Bandito, causing Fred to want to make himself a legend just like El Bandito. During the mystery, Daphne believes her deceased Aunt Cookie is communicating with her somehow.

After Daphne agrees to babysit her friend's son, Wayne, the gang ends up going to an amusement park where an insane killer clown is lurking. Daphne attempts to focus on allowing Wayne to have a good time, but the rest of the gang investigates the park and tries to solve the mystery of Madcap, the killer clown.

Fred attempts to hone the gang's mystery solving skills by taking them out camping in the wilderness. A perfect mystery opportunity soon comes along when they discover that viking ghosts have scared away all the tourists from camping in the area. However, the gang has to avoid the park ranger in the process, or risk being sent to "Forest Jail" forever.

Fred is put on trial after he is wrongfully accused of dressing up as a toxic waste mutant. The trial goes further awry after Fred is accused of inventing every mystery he has ever solved. Though Daphne agrees on being Fred's defense lawyer, her and the rest of the gang's antics serve no help to Fred, who risks being put away in prison if charged with the crime.