D'étranges salves d'énergie émises aux confins de la galaxie poussent Starfleet à nommer le capitaine Pike à la tête du Discovery afin de mener l'enquête.

Une sphère qui pourrait être dotée d'intelligence prend Discovery au piège, tandis que Saru subit une transformation physique troublante, et que Tilly se fait posséder.

Un nouveau signal attire le Discovery sur Boreth, la lune klingonne, où une précieuse ressource donne à Pike un étonnant aperçu du futur.

Avec l'armada de la Section 31 à ses trousses, l'équipage du Discovery abandonne le vaisseau tandis que Michael propose une mission qui pourrait bien être la dernière.

Spock et Michael parviennent enfin à s'entendre, tandis que les possibilités se réduisent pour le capitaine Pike, qui est confronté à de puissantes forces.

En arrivant au 32e siècle, le Discovery s'écrase sur un monde gelé. Alors que l'équipage répare le vaisseau, Saru et Tilly s'aventurent jusqu'à un campement voisin.

Le Discovery trouve les restes de la Starfleet sous la garde du prudent amiral Vance. Malgré ses doutes, ce dernier assigne sa première mission à l'équipage.

Piégé dans l'univers Miroir, l'Empereur Georgiou cherche à changer le cours de l'histoire mais se heurte à un obstacle infranchissable : Michael.

L'équipage du Discovery suit un mystérieux signal au cœur d'une dangereuse nébuleuse. Il secourt alors un unique survivant kelpien et découvre l'origine du Brasier.

Tandis que Saru tente de persuader Su'Kal d'abandonner son holoprogramme, Michael et Book affrontent Osyraa et la Chaîne d'Émeraude dans une ultime bataille.

Burnham et Book se précipitent pour évacuer un groupe de colons bloqués sur le chemin de l'anomalie alors que l'un des scientifiques les plus brillants de la Fédération arrive à bord de l'U.S.S. Discovery pour faire des recherches à gros enjeux avec Saru et Stamets.

Alors que le capitaine Burnham mène une mission avancée sur une planète qui abritait autrefois les extraterrestres responsables de l'anomalie de la matière noire, Book et Tarka infiltrent secrètement l'USS Discovery.

Alors que l'anomalie de la matière noire approche de la Terre et de Ni'Var, le capitaine Burnham et l'équipage de l'USS Discovery tentent d'établir un premier contact avec la puissante espèce responsable avant qu'il ne soit trop tard.

L'Anomalie approche de la Terre et de Ni'Var. Avec les évacuations en cours, Burnham et l'équipage du Discovery doit trouver un moyen de communiquer et de se connecter avec une espèce très différente de la sienne avant la fin du temps imparti.

Sur Trill, le capitaine Burnham, Book et Culber doivent passer un test dangereux pour prouver qu'ils sont dignes du prochain indice. Adira renoue avec Gray et le premier jour de Saru en tant qu'ambassadeur est compliqué par ses fiançailles avec T'Rina.

En route vers le prochain indice, l'U.S.S. Discovery est saboté par une arme mystérieuse. La capitaine Burnham, Rayner et Stamets sont les seuls membres de l'équipage à pouvoir sauver le vaisseau à temps.

Alors que Moll et L'ak sont enfin détenus, la Fédération se retrouve au cœur d'une tempête diplomatique et éthique lorsque les Breens arrivent et exigent qu'ils leur soient livrés.

Quand Burnham est piégée dans un"paysage mental"conçu pour tester sa capacité à récupérer la puissante technologie des Progéniteurs, Book, Rayner et l'équipage du Discovery doivent repousser les Breens assez longtemps pour qu'elle puisse s'échapper.

Piégée à l'intérieur d'un mystérieux portail extraterrestre qui défie les règles familières du temps, de l'espace et de la gravité, la capitaine Burnham doit combattre Moll – et l'environnement lui-même – afin de localiser la technologie des Progéniteurs et de la sécuriser pour la Fédération. Pendant ce temps, Book se met en danger pour aider Burnham à survivre et Rayner dirige l'U.S.S. Discovery dans une bataille épique où le vainqueur remporte tout contre les forces Breen.