Pese a las reticencias de Elias, Chise comienza su nueva etapa de estudiante. Tal vez sus nuevos estudios la ayuden a comprenderse mejor a sí misma y a no a arriesgar su vida para ayudar a otros como tantas veces hizo anteriormente.

Chise comienza sus clases, incluyendo la primera lección de Elias. Que sea maga no tarda en llamar la atención entre sus compañeros, aunque todos parecen emocionados con su presencia y se siente bien recibida.

Chise comienza a conocer a sus compañeros en la escuela de magia, y aunque todos parece que podrá entablar buena relación con todos, ocurren ciertas cosas de fondo.

Chise parece haber llegado a otro lugar y se ha separado de su amiga, pero parece ser que quien la ha invocado es alguien que conoce muy bien a Elias.

Chise tiene una extraña relación con Lucy, su compañera de cuarto, quien a todos parece una persona de pocos amigos. El pasar tiempo con ella derivará en que la situación con Zoe explote y...

La relación de Alice y Renfred se convierte en tema de preocupación para la amiga de Chise, quien no dudará en contarle sus penas.

Chise se está acostumbrando poco a poco a las clases, pero sigue sintiéndose insegura.

Chise y sus compañeros parten a la excursión de campo donde intentarán adquirir nociones de supervivencia, pero como la muchacha esperaba, Elias insiste en acompañarla.

Chise no se separa de Lucy, quien ya lleva diez días en coma tras el incidente en el que perdió su maná. Mientras, enfrenta la decisión que tomó para salvar su vida, se pregunta qué ocasionó el incidente y el profesorado descubre un serio incidente que podría tener relación con el tabú de lo que ocurrió con los Webster.

Lucy tiene mejor aspecto tras unos días de recuperación. Tan pronto como le es posible decide encarar a su hermano, pero cuando se prepara para acompañarlo fuera, los atacan.

Mientras las cosas se complican bajo tierra para Chise y Zoe, en la superficie, la abuela de Philomela se prepara para hablar con la decana mientras esta se dispone a tomar medidas especiales ante los sucesos recientes.

La academia está confinada debido a los recientes incidentes, así que es momento de que el profesorado imparta unas clases especiales a los alumnos: supervivencia y defensa.

Estando encerrados, los estudiantes deben procurarse sus alimentos a la par que están atentos para un posible ataque, aunque a Chise le preocupa la situación de cierta persona a la que considera una amiga.

Los estudiantes se aburren encerrados y Violet pensó en ello, así que lleva un peculiar juego para practicar entre todos. Mientras, Alcyone habla con Elias, de quien tenía una percepción equivocada.

Una prueba de valor será el escenario ideal para que Chise pregunte a Veronica por la situación de Philomela y aprenda algo más sobre la relación de ambas.

Los estudiantes siguen encerrados, pero el responsable de los ataques sigue su curso y se produce un nuevo acontecimiento que da un nuevo giro a las cosas.

El confinamiento sigue adelante, pero Chise comienza a sentir cerca el libro de hechicería y a su usuario.

Ahora que se ha descubierto que Philomela era quien poseía el Grimorio, la situación cambia por completo. Aunque algunas personas la dan por perdida, Chise no quiere abandonar a su amiga.

Conocemos el pasado de los padres de Philomela mientras Chise, Elias y el resto intentan llegar a casa de los Sergeant para ayudar a su amiga, aunque vivirán un inesperado encuentro en el camino.

Chise y el resto llegan a la mansión buscando a Philomela, aunque es con Alcyone con la primera con la que se encuentran.

Tras mucho dudar y pensar, Philomela por fin se decide a decir lo que siente y lo que quiere de verdad.

Lizbeth complica la situación y aparece en escena lo que parece ser otro dios, aunque incompleto.

El duelo final entre Philomela y su abuela desata nuevas consecuencias.